RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542167.2

PUS1-208, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUS1, Length 2,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-208ENST00000542167 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.25■■■■□ 3.07
PUS1-208ENST00000542167 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.89■■■□□ 2.38
PUS1-208ENST00000542167 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PUS1-208ENST00000542167 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.54■■■□□ 2.16
PUS1-208ENST00000542167 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.38■■■□□ 2.13
PUS1-208ENST00000542167 ABCC9O60706 1549 aa28.36■■■□□ 2.13
PUS1-208ENST00000542167 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.28■■■□□ 2.12
PUS1-208ENST00000542167 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PUS1-208ENST00000542167 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.94■■■□□ 2.06
PUS1-208ENST00000542167 NACADO15069 1562 aa27.83■■■□□ 2.05
PUS1-208ENST00000542167 HRCP23327 699 aa27.73■■■□□ 2.03
PUS1-208ENST00000542167 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.7■■■□□ 2.02
PUS1-208ENST00000542167 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.63■■■□□ 2.01
PUS1-208ENST00000542167 SCRIBQ14160 1630 aa27.55■■■□□ 2
PUS1-208ENST00000542167 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.29■■□□□ 1.96
PUS1-208ENST00000542167 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.14■■□□□ 1.94
PUS1-208ENST00000542167 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PUS1-208ENST00000542167 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.85■■□□□ 1.89
PUS1-208ENST00000542167 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.81■■□□□ 1.88
PUS1-208ENST00000542167 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
PUS1-208ENST00000542167 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PUS1-208ENST00000542167 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.65■■□□□ 1.86
PUS1-208ENST00000542167 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PUS1-208ENST00000542167 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.49■■□□□ 1.83
PUS1-208ENST00000542167 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PUS1-208ENST00000542167 SMARCA4P51532 1647 aa26.36■■□□□ 1.81
PUS1-208ENST00000542167 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PUS1-208ENST00000542167 WIZO95785 1651 aa26.3■■□□□ 1.8
PUS1-208ENST00000542167 TRIM41Q8WV44 630 aa26.2■■□□□ 1.79
PUS1-208ENST00000542167 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PUS1-208ENST00000542167 PEG3Q9GZU2 1588 aa26■■□□□ 1.75
PUS1-208ENST00000542167 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PUS1-208ENST00000542167 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PUS1-208ENST00000542167 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PUS1-208ENST00000542167 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.92■■□□□ 1.74
PUS1-208ENST00000542167 SMARCA2P51531 1590 aa25.9■■□□□ 1.74
PUS1-208ENST00000542167 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PUS1-208ENST00000542167 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PUS1-208ENST00000542167 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.72■■□□□ 1.71
PUS1-208ENST00000542167 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.72■■□□□ 1.71
PUS1-208ENST00000542167 NCAPD3P42695 1498 aa25.68■■□□□ 1.7
PUS1-208ENST00000542167 HMGXB3Q12766 1538 aa25.66■■□□□ 1.7
PUS1-208ENST00000542167 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.65■■□□□ 1.7
PUS1-208ENST00000542167 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PUS1-208ENST00000542167 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
PUS1-208ENST00000542167 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PUS1-208ENST00000542167 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PUS1-208ENST00000542167 ABCC8Q09428 1581 aa25.34■■□□□ 1.65
PUS1-208ENST00000542167 NEUROD1Q13562 356 aa25.34■■□□□ 1.65
PUS1-208ENST00000542167 CEP162Q5TB80 1403 aa25.29■■□□□ 1.64
PUS1-208ENST00000542167 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PUS1-208ENST00000542167 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.19■■□□□ 1.62
PUS1-208ENST00000542167 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PUS1-208ENST00000542167 SOGA1O94964 1423 aa25.14■■□□□ 1.62
PUS1-208ENST00000542167 EEA1Q15075 1411 aa25.13■■□□□ 1.61
PUS1-208ENST00000542167 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.11■■□□□ 1.61
PUS1-208ENST00000542167 CFTRP13569 1480 aa25.11■■□□□ 1.61
PUS1-208ENST00000542167 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PUS1-208ENST00000542167 PRDM2Q13029 1718 aa25.04■■□□□ 1.6
PUS1-208ENST00000542167 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.03■■□□□ 1.6
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PUS1-208ENST00000542167 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.01■■□□□ 1.59
PUS1-208ENST00000542167 GOLGA3Q08378 1498 aa25■■□□□ 1.59
PUS1-208ENST00000542167 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.97■■□□□ 1.59
PUS1-208ENST00000542167 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
PUS1-208ENST00000542167 SYNJ1O43426 1573 aa24.94■■□□□ 1.58
PUS1-208ENST00000542167 NESP48681 1621 aa24.88■■□□□ 1.57
PUS1-208ENST00000542167 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PUS1-208ENST00000542167 KIF21BO75037 1637 aa24.86■■□□□ 1.57
PUS1-208ENST00000542167 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.84■■□□□ 1.57
PUS1-208ENST00000542167 TOP2BQ02880 1626 aa24.81■■□□□ 1.56
PUS1-208ENST00000542167 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.8■■□□□ 1.56
PUS1-208ENST00000542167 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.8■■□□□ 1.56
PUS1-208ENST00000542167 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.78■■□□□ 1.56
PUS1-208ENST00000542167 CUX1P39880 1505 aa24.77■■□□□ 1.56
PUS1-208ENST00000542167 MYT1Q01538 1121 aa24.75■■□□□ 1.55
PUS1-208ENST00000542167 CLIP1P30622 1438 aa24.69■■□□□ 1.54
PUS1-208ENST00000542167 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.69■■□□□ 1.54
PUS1-208ENST00000542167 MIER1Q8N108 512 aa24.66■■□□□ 1.54
PUS1-208ENST00000542167 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PUS1-208ENST00000542167 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.64■■□□□ 1.53
PUS1-208ENST00000542167 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PUS1-208ENST00000542167 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.6■■□□□ 1.53
PUS1-208ENST00000542167 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.55■■□□□ 1.52
PUS1-208ENST00000542167 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.54■■□□□ 1.52
PUS1-208ENST00000542167 TOPBP1Q92547 1522 aa24.52■■□□□ 1.52
PUS1-208ENST00000542167 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.51■■□□□ 1.51
PUS1-208ENST00000542167 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PUS1-208ENST00000542167 APLP2Q06481 763 aa24.4■■□□□ 1.5
PUS1-208ENST00000542167 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.39■■□□□ 1.5
PUS1-208ENST00000542167 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PUS1-208ENST00000542167 KIF27Q86VH2 1401 aa24.37■■□□□ 1.49
PUS1-208ENST00000542167 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PUS1-208ENST00000542167 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.35■■□□□ 1.49
PUS1-208ENST00000542167 CUX2O14529 1486 aa24.35■■□□□ 1.49
PUS1-208ENST00000542167 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.34■■□□□ 1.49
PUS1-208ENST00000542167 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.33■■□□□ 1.49
PUS1-208ENST00000542167 ERCC6Q03468 1493 aa24.31■■□□□ 1.48
PUS1-208ENST00000542167 ARAP1Q96P48 1450 aa24.31■■□□□ 1.48
PUS1-208ENST00000542167 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.27■■□□□ 1.48
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