RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456665.6

PUS1-204, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-204ENST00000456665 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.59■■■■■ 6.97
PUS1-204ENST00000456665 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.16■■■■■ 5.94
PUS1-204ENST00000456665 ABCC9O60706 1549 aa50.81■■■■■ 5.72
PUS1-204ENST00000456665 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.04■■■■■ 5.44
PUS1-204ENST00000456665 NACADO15069 1562 aa49.02■■■■■ 5.44
PUS1-204ENST00000456665 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.84■■■■■ 5.41
PUS1-204ENST00000456665 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
PUS1-204ENST00000456665 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.79■■■■■ 5.4
PUS1-204ENST00000456665 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.58■■■■■ 5.37
PUS1-204ENST00000456665 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.87■■■■■ 5.25
PUS1-204ENST00000456665 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.45■■■■■ 5.19
PUS1-204ENST00000456665 SCRIBQ14160 1630 aa47.45■■■■■ 5.19
PUS1-204ENST00000456665 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.44■■■■■ 5.18
PUS1-204ENST00000456665 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.14■■■■■ 5.14
PUS1-204ENST00000456665 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.5■■■■■ 5.03
PUS1-204ENST00000456665 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
PUS1-204ENST00000456665 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.03■■■■■ 4.96
PUS1-204ENST00000456665 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.7■■■■■ 4.91
PUS1-204ENST00000456665 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
PUS1-204ENST00000456665 SMARCA4P51532 1647 aa45.45■■■■■ 4.87
PUS1-204ENST00000456665 SMARCA2P51531 1590 aa45.2■■■■■ 4.83
PUS1-204ENST00000456665 NCAPD3P42695 1498 aa45.19■■■■■ 4.82
PUS1-204ENST00000456665 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.18■■■■■ 4.82
PUS1-204ENST00000456665 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.09■■■■■ 4.81
PUS1-204ENST00000456665 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.07■■■■■ 4.8
PUS1-204ENST00000456665 HMGXB3Q12766 1538 aa45■■■■■ 4.79
PUS1-204ENST00000456665 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
PUS1-204ENST00000456665 WIZO95785 1651 aa44.62■■■■■ 4.73
PUS1-204ENST00000456665 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
PUS1-204ENST00000456665 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
PUS1-204ENST00000456665 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.02■■■■■ 4.64
PUS1-204ENST00000456665 NESP48681 1621 aa43.95■■■■■ 4.63
PUS1-204ENST00000456665 ERCC6Q03468 1493 aa43.86■■■■■ 4.61
PUS1-204ENST00000456665 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.86■■■■■ 4.61
PUS1-204ENST00000456665 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.72■■■■■ 4.59
PUS1-204ENST00000456665 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.64■■■■■ 4.58
PUS1-204ENST00000456665 CFTRP13569 1480 aa43.61■■■■■ 4.57
PUS1-204ENST00000456665 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.52■■■■■ 4.56
PUS1-204ENST00000456665 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
PUS1-204ENST00000456665 CUX2O14529 1486 aa43.45■■■■■ 4.55
PUS1-204ENST00000456665 PRDM2Q13029 1718 aa43.37■■■■■ 4.53
PUS1-204ENST00000456665 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
PUS1-204ENST00000456665 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.33■■■■■ 4.53
PUS1-204ENST00000456665 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.3■■■■■ 4.52
PUS1-204ENST00000456665 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.22■■■■■ 4.51
PUS1-204ENST00000456665 WDR62O43379 1518 aa43.08■■■■■ 4.49
PUS1-204ENST00000456665 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
PUS1-204ENST00000456665 ABCC8Q09428 1581 aa42.78■■■■■ 4.44
PUS1-204ENST00000456665 TOPBP1Q92547 1522 aa42.65■■■■■ 4.42
PUS1-204ENST00000456665 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.64■■■■■ 4.42
PUS1-204ENST00000456665 IFT140Q96RY7 1462 aa42.41■■■■■ 4.38
PUS1-204ENST00000456665 CUX1P39880 1505 aa42.3■■■■■ 4.36
PUS1-204ENST00000456665 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
PUS1-204ENST00000456665 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
PUS1-204ENST00000456665 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
PUS1-204ENST00000456665 SOGA1O94964 1423 aa42.12■■■■■ 4.33
PUS1-204ENST00000456665 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.11■■■■■ 4.33
PUS1-204ENST00000456665 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
PUS1-204ENST00000456665 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.04■■■■■ 4.32
PUS1-204ENST00000456665 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.04■■■■■ 4.32
PUS1-204ENST00000456665 TOP2BQ02880 1626 aa42.03■■■■■ 4.32
PUS1-204ENST00000456665 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
PUS1-204ENST00000456665 WDR97A6NE52 1622 aa41.99■■■■■ 4.31
PUS1-204ENST00000456665 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.97■■■■■ 4.31
PUS1-204ENST00000456665 SYNJ1O43426 1573 aa41.94■■■■■ 4.3
PUS1-204ENST00000456665 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.35e-8■■■■□ 24.5
PUS1-204ENST00000456665 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
PUS1-204ENST00000456665 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.82■■■■■ 4.29
PUS1-204ENST00000456665 GRIN2BQ13224 1484 aa41.65■■■■■ 4.26
PUS1-204ENST00000456665 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.65■■■■■ 4.26
PUS1-204ENST00000456665 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.64■■■■■ 4.26
PUS1-204ENST00000456665 OSCARQ8IYS5 282 aa41.62■■■■■ 4.25
PUS1-204ENST00000456665 PBRM1Q86U86 1689 aa41.57■■■■■ 4.25
PUS1-204ENST00000456665 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
PUS1-204ENST00000456665 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.53■■■■■ 4.24
PUS1-204ENST00000456665 CHD1O14646 1710 aa41.47■■■■■ 4.23
PUS1-204ENST00000456665 FBLN2P98095 1184 aa41.38■■■■■ 4.21
PUS1-204ENST00000456665 SYNJ2O15056 1496 aa41.37■■■■■ 4.21
PUS1-204ENST00000456665 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.35■■■■■ 4.21
PUS1-204ENST00000456665 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
PUS1-204ENST00000456665 KIF27Q86VH2 1401 aa41.26■■■■■ 4.19
PUS1-204ENST00000456665 ADAMTS12P58397 1594 aa41.22■■■■■ 4.19
PUS1-204ENST00000456665 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.19■■■■■ 4.18
PUS1-204ENST00000456665 TRIM41Q8WV44 630 aa41.14■■■■■ 4.18
PUS1-204ENST00000456665 GRIN2AQ12879 1464 aa41.09■■■■■ 4.17
PUS1-204ENST00000456665 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.03■■■■■ 4.16
PUS1-204ENST00000456665 IGF1RP08069 1367 aa41.02■■■■■ 4.16
PUS1-204ENST00000456665 CUL7Q14999 1698 aa41.01■■■■■ 4.15
PUS1-204ENST00000456665 NUP160Q12769 1436 aa40.92■■■■■ 4.14
PUS1-204ENST00000456665 ARHGEF11O15085 1522 aa40.91■■■■■ 4.14
PUS1-204ENST00000456665 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
PUS1-204ENST00000456665 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
PUS1-204ENST00000456665 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
PUS1-204ENST00000456665 CEP170Q5SW79 1584 aa40.85■■■■■ 4.13
PUS1-204ENST00000456665 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.81■■■■■ 4.12
PUS1-204ENST00000456665 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.75■■■■■ 4.11
PUS1-204ENST00000456665 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.62■■■■■ 4.09
PUS1-204ENST00000456665 SHROOM2Q13796 1616 aa40.62■■■■■ 4.09
PUS1-204ENST00000456665 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.59■■■■■ 4.09
PUS1-204ENST00000456665 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.57■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.6 ms