Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE4BQ07343 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4BQ07343 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4BQ07343 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PDE4BQ07343 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE4BQ07343 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4BQ07343 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms