Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK3Q00526 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK3Q00526 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK3Q00526 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK3Q00526 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms