Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OXCT1P55809 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OXCT1P55809 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OXCT1P55809 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms