Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKAA2P54646 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAA2P54646 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA2P54646 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAA2P54646 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA2P54646 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms