Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRKAA2P54646 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRKAA2P54646 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRKAA2P54646 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRKAA2P54646 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PRKAA2P54646 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRKAA2P54646 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKAA2P54646 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKAA2P54646 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKAA2P54646 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRKAA2P54646 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKAA2P54646 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKAA2P54646 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKAA2P54646 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRKAA2P54646 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRKAA2P54646 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRKAA2P54646 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRKAA2P54646 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKAA2P54646 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRKAA2P54646 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRKAA2P54646 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKAA2P54646 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKAA2P54646 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKAA2P54646 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRKAA2P54646 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKAA2P54646 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRKAA2P54646 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRKAA2P54646 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKAA2P54646 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKAA2P54646 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRKAA2P54646 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKAA2P54646 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRKAA2P54646 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRKAA2P54646 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKAA2P54646 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRKAA2P54646 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRKAA2P54646 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKAA2P54646 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKAA2P54646 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKAA2P54646 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKAA2P54646 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKAA2P54646 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAA2P54646 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKAA2P54646 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAA2P54646 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKAA2P54646 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKAA2P54646 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKAA2P54646 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKAA2P54646 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKAA2P54646 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKAA2P54646 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRKAA2P54646 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAA2P54646 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKAA2P54646 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKAA2P54646 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKAA2P54646 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKAA2P54646 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKAA2P54646 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKAA2P54646 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAA2P54646 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKAA2P54646 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAA2P54646 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKAA2P54646 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKAA2P54646 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKAA2P54646 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKAA2P54646 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKAA2P54646 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKAA2P54646 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKAA2P54646 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKAA2P54646 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKAA2P54646 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKAA2P54646 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKAA2P54646 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAA2P54646 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKAA2P54646 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKAA2P54646 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKAA2P54646 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAA2P54646 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKAA2P54646 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKAA2P54646 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKAA2P54646 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAA2P54646 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKAA2P54646 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKAA2P54646 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKAA2P54646 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKAA2P54646 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAA2P54646 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAA2P54646 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKAA2P54646 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKAA2P54646 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAA2P54646 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKAA2P54646 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKAA2P54646 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKAA2P54646 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKAA2P54646 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKAA2P54646 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKAA2P54646 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKAA2P54646 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKAA2P54646 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKAA2P54646 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms