Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D1P54289 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D1P54289 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D1P54289 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CACNA2D1P54289 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D1P54289 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms