Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTDSS1P48651 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTDSS1P48651 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTDSS1P48651 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms