Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNNT2P45379 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNNT2P45379 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNNT2P45379 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNNT2P45379 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNNT2P45379 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TNNT2P45379 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNNT2P45379 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNNT2P45379 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms