Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 218.63■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 315.22■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 LAMTOR4-212ENST00000494136 427 ntTSL 29.23□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 56.4
GTF2F1P35269 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 56.4
GTF2F1P35269 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.853e-15■■■■■ 56.2
GTF2F1P35269 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-15■■■■■ 56.2
GTF2F1P35269 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.023e-15■■■■■ 56.2
GTF2F1P35269 A2M-211ENST00000543436 600 ntTSL 512.69□□□□□ -0.388e-10■■■■■ 56.1
GTF2F1P35269 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.058e-10■■■■■ 56.1
GTF2F1P35269 A2M-210ENST00000542567 563 ntTSL 47.69□□□□□ -1.188e-10■■■■■ 56.1
GTF2F1P35269 A2M-212ENST00000545828 471 ntTSL 47.39□□□□□ -1.238e-10■■■■■ 56.1
GTF2F1P35269 ZNF316-202ENST00000427912 520 ntTSL 315.94■□□□□ 0.141e-10■■■■■ 56
GTF2F1P35269 CHTF8-211ENST00000567763 734 ntTSL 227.06■■□□□ 1.926e-7■■■■■ 55.9
GTF2F1P35269 CHTF8-209ENST00000522497 831 ntTSL 227.05■■□□□ 1.926e-7■■■■■ 55.9
GTF2F1P35269 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 55.9
GTF2F1P35269 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.666e-7■■■■■ 55.9
GTF2F1P35269 ARHGEF10L-205ENST00000466782 482 ntTSL 311.58□□□□□ -0.565e-9■■■■■ 55.7
GTF2F1P35269 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 510.96□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 55.5
GTF2F1P35269 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.793e-9■■■■■ 55.4
GTF2F1P35269 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 55.4
GTF2F1P35269 PRPF40B-206ENST00000547764 803 ntTSL 320.5■□□□□ 0.872e-15■■■■■ 55.4
GTF2F1P35269 PRPF40B-216ENST00000552301 912 ntTSL 520.11■□□□□ 0.812e-15■■■■■ 55.4
GTF2F1P35269 PRPF40B-211ENST00000551063 531 ntTSL 416.83■□□□□ 0.282e-15■■■■■ 55.4
GTF2F1P35269 CDK16-217ENST00000522234 1679 ntTSL 222.5■■□□□ 1.191e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-216ENST00000520893 943 ntTSL 522.4■■□□□ 1.181e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.11e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-208ENST00000517426 1574 ntTSL 521.26■□□□□ 0.991e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.941e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.711e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 AP2A2-223ENST00000534485 556 ntTSL 419.05■□□□□ 0.641e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-213ENST00000519758 991 ntTSL 318.99■□□□□ 0.631e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 AP2A2-210ENST00000527024 527 ntTSL 418.58■□□□□ 0.561e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 AP2A2-221ENST00000531548 554 ntTSL 418.58■□□□□ 0.561e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-212ENST00000518391 785 ntTSL 317.39■□□□□ 0.371e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 217.24■□□□□ 0.351e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-215ENST00000520295 573 ntTSL 417.06■□□□□ 0.321e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-218ENST00000522883 601 ntTSL 415.06■□□□□ 01e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 514.5□□□□□ -0.091e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 TM9SF4-204ENST00000442842 563 ntTSL 414.41□□□□□ -0.11e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 TM9SF4-203ENST00000417389 553 ntTSL 412.09□□□□□ -0.471e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 AP2A2-203ENST00000524559 935 ntTSL 512.01□□□□□ -0.491e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 511.86□□□□□ -0.511e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.611e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.721e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 AC090115.1-201ENST00000548257 562 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.771e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 AP2A2-219ENST00000530801 557 ntTSL 49.24□□□□□ -0.931e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.211e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 TM9SF4-205ENST00000450829 550 ntTSL 46.3□□□□□ -1.41e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 AP2A2-209ENST00000526753 464 ntTSL 44.3□□□□□ -1.721e-13■■■■■ 55.2
GTF2F1P35269 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.583e-23■■■■■ 55.1
GTF2F1P35269 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 54.9
GTF2F1P35269 ANKFY1-203ENST00000570934 1881 ntTSL 517.12■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 54.9
GTF2F1P35269 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 54.9
GTF2F1P35269 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 54.9
GTF2F1P35269 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 28.36□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 54.9
GTF2F1P35269 ANKFY1-207ENST00000573250 588 ntTSL 58.18□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 54.9
GTF2F1P35269 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.662e-26■■■■■ 54.9
GTF2F1P35269 WNT5B-205ENST00000539198 530 ntTSL 423.96■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 WNT5B-210ENST00000545811 661 ntTSL 221.31■■□□□ 11e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-222ENST00000600320 913 ntTSL 521.33■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-221ENST00000599833 761 ntTSL 221.26■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-214ENST00000597396 1019 ntTSL 321.25■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-202ENST00000593764 870 ntTSL 320.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-205ENST00000594973 2339 ntTSL 220.31■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-227ENST00000602011 897 ntTSL 520.28■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-203ENST00000594298 716 ntTSL 319.91■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-204ENST00000594862 623 ntTSL 319.53■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-215ENST00000597649 781 ntTSL 519■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-224ENST00000600718 1993 ntTSL 518.93■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-216ENST00000598201 2069 ntTSL 218.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-212ENST00000596163 785 ntTSL 318.78■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 SHKBP1-208ENST00000595726 684 ntTSL 316.21■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 54.6
GTF2F1P35269 FBXL19-208ENST00000565939 817 ntTSL 218.92■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 54.5
GTF2F1P35269 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-42■■■■■ 54.4
GTF2F1P35269 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 54.3
GTF2F1P35269 PROC-209ENST00000464089 563 ntTSL 420.06■□□□□ 0.88e-15■■■■■ 54.1
GTF2F1P35269 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.342e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-216ENST00000496861 1351 ntTSL 1 (best)26.88■■□□□ 1.892e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-213ENST00000491497 1078 ntTSL 516.15■□□□□ 0.182e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-209ENST00000479266 567 ntTSL 315.91■□□□□ 0.142e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-212ENST00000486962 550 ntTSL 315.46■□□□□ 0.072e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -02e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-208ENST00000478277 370 ntTSL 314.05□□□□□ -0.162e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-215ENST00000496768 790 ntTSL 313.25□□□□□ -0.292e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-214ENST00000492411 823 ntTSL 513.25□□□□□ -0.292e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 NIT1-207ENST00000477684 499 ntTSL 310.17□□□□□ -0.782e-13■■■■■ 54
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 58 ms