RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496861.5

NIT1-216, Transcript of nitrilase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NIT1, Length 1,351 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT1-216ENST00000496861 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.9■■■■■ 7.18
NIT1-216ENST00000496861 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.05■■■■■ 6.08
NIT1-216ENST00000496861 ABCC9O60706 1549 aa51.24■■■■■ 5.79
NIT1-216ENST00000496861 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
NIT1-216ENST00000496861 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.97■■■■■ 5.59
NIT1-216ENST00000496861 NACADO15069 1562 aa49.71■■■■■ 5.55
NIT1-216ENST00000496861 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.64■■■■■ 5.54
NIT1-216ENST00000496861 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.59■■■■■ 5.53
NIT1-216ENST00000496861 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.55■■■■■ 5.52
NIT1-216ENST00000496861 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.5■■■■■ 5.35
NIT1-216ENST00000496861 SCRIBQ14160 1630 aa48.46■■■■■ 5.35
NIT1-216ENST00000496861 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48■■■■■ 5.278e-8■■■■■ 28.9
NIT1-216ENST00000496861 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.96■■■■■ 5.27
NIT1-216ENST00000496861 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.77■■■■■ 5.24
NIT1-216ENST00000496861 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
NIT1-216ENST00000496861 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.54■■■■■ 5.04
NIT1-216ENST00000496861 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
NIT1-216ENST00000496861 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.39■■■■■ 5.02
NIT1-216ENST00000496861 SMARCA4P51532 1647 aa46.37■■■■■ 5.01
NIT1-216ENST00000496861 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.31■■■■■ 5
NIT1-216ENST00000496861 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.14■■■■■ 4.98
NIT1-216ENST00000496861 SMARCA2P51531 1590 aa45.98■■■■■ 4.95
NIT1-216ENST00000496861 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.91■■■■■ 4.94
NIT1-216ENST00000496861 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.86■■■■■ 4.93
NIT1-216ENST00000496861 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
NIT1-216ENST00000496861 NCAPD3P42695 1498 aa45.78■■■■■ 4.92
NIT1-216ENST00000496861 WIZO95785 1651 aa45.75■■■■■ 4.91
NIT1-216ENST00000496861 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
NIT1-216ENST00000496861 HMGXB3Q12766 1538 aa45.66■■■■■ 4.9
NIT1-216ENST00000496861 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
NIT1-216ENST00000496861 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
NIT1-216ENST00000496861 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.73■■■■■ 4.75
NIT1-216ENST00000496861 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.57■■■■■ 4.72
NIT1-216ENST00000496861 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.53■■■■■ 4.72
NIT1-216ENST00000496861 NESP48681 1621 aa44.49■■■■■ 4.71
NIT1-216ENST00000496861 CFTRP13569 1480 aa44.37■■■■■ 4.69
NIT1-216ENST00000496861 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.27■■■■■ 4.68
NIT1-216ENST00000496861 PRDM2Q13029 1718 aa44.24■■■■■ 4.67
NIT1-216ENST00000496861 ERCC6Q03468 1493 aa44.23■■■■■ 4.67
NIT1-216ENST00000496861 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.07■■■■■ 4.65
NIT1-216ENST00000496861 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.04■■■■■ 4.64
NIT1-216ENST00000496861 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.96■■■■■ 4.63
NIT1-216ENST00000496861 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.72■■■■■ 4.59
NIT1-216ENST00000496861 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
NIT1-216ENST00000496861 WDR62O43379 1518 aa43.52■■■■■ 4.56
NIT1-216ENST00000496861 ABCC8Q09428 1581 aa43.51■■■■■ 4.56
NIT1-216ENST00000496861 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
NIT1-216ENST00000496861 CUX2O14529 1486 aa43.44■■■■■ 4.55
NIT1-216ENST00000496861 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.43■■■■■ 4.54
NIT1-216ENST00000496861 TOPBP1Q92547 1522 aa43.38■■■■■ 4.54
NIT1-216ENST00000496861 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.3■■■■■ 4.52
NIT1-216ENST00000496861 CUX1P39880 1505 aa43.27■■■■■ 4.52
NIT1-216ENST00000496861 TOP2BQ02880 1626 aa43.12■■■■■ 4.49
NIT1-216ENST00000496861 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.11■■■■■ 4.49
NIT1-216ENST00000496861 SYNJ1O43426 1573 aa43.1■■■■■ 4.49
NIT1-216ENST00000496861 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.06■■■■■ 4.48
NIT1-216ENST00000496861 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
NIT1-216ENST00000496861 IFT140Q96RY7 1462 aa42.99■■■■■ 4.47
NIT1-216ENST00000496861 SOGA1O94964 1423 aa42.94■■■■■ 4.47
NIT1-216ENST00000496861 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.85■■■■■ 4.45
NIT1-216ENST00000496861 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
NIT1-216ENST00000496861 TRIM41Q8WV44 630 aa42.81■■■■■ 4.44
NIT1-216ENST00000496861 WDR97A6NE52 1622 aa42.66■■■■■ 4.42
NIT1-216ENST00000496861 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.66■■■■■ 4.42
NIT1-216ENST00000496861 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
NIT1-216ENST00000496861 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
NIT1-216ENST00000496861 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.59■■■■■ 4.41
NIT1-216ENST00000496861 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
NIT1-216ENST00000496861 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.54■■■■■ 4.43e-6■■■■□ 24.7
NIT1-216ENST00000496861 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.46■■■■■ 4.39
NIT1-216ENST00000496861 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.43■■■■■ 4.38
NIT1-216ENST00000496861 KIF27Q86VH2 1401 aa42.38■■■■■ 4.37
NIT1-216ENST00000496861 PBRM1Q86U86 1689 aa42.37■■■■■ 4.37
NIT1-216ENST00000496861 GRIN2BQ13224 1484 aa42.36■■■■■ 4.37
NIT1-216ENST00000496861 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.21■■■■■ 4.35
NIT1-216ENST00000496861 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.19■■■■■ 4.34
NIT1-216ENST00000496861 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
NIT1-216ENST00000496861 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.06■■■■■ 4.32
NIT1-216ENST00000496861 FBLN2P98095 1184 aa42.05■■■■■ 4.32
NIT1-216ENST00000496861 IGF1RP08069 1367 aa42.03■■■■■ 4.32
NIT1-216ENST00000496861 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
NIT1-216ENST00000496861 EEA1Q15075 1411 aa42.02■■■■■ 4.32
NIT1-216ENST00000496861 CUL7Q14999 1698 aa42■■■■■ 4.31
NIT1-216ENST00000496861 SYNJ2O15056 1496 aa41.99■■■■■ 4.31
NIT1-216ENST00000496861 ADAMTS12P58397 1594 aa41.99■■■■■ 4.31
NIT1-216ENST00000496861 CHD1O14646 1710 aa41.99■■■■■ 4.31
NIT1-216ENST00000496861 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.98■■■■■ 4.31
NIT1-216ENST00000496861 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
NIT1-216ENST00000496861 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.87■■■■■ 4.29
NIT1-216ENST00000496861 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.85■■■■■ 4.29
NIT1-216ENST00000496861 OSCARQ8IYS5 282 aa41.82■■■■■ 4.29
NIT1-216ENST00000496861 GRIN2AQ12879 1464 aa41.79■■■■■ 4.28
NIT1-216ENST00000496861 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.7■■■■■ 4.27
NIT1-216ENST00000496861 PRXQ9BXM0 1461 aa41.62■■■■■ 4.25
NIT1-216ENST00000496861 CEP170Q5SW79 1584 aa41.53■■■■■ 4.24
NIT1-216ENST00000496861 NUP160Q12769 1436 aa41.52■■■■■ 4.24
NIT1-216ENST00000496861 KIF21BO75037 1637 aa41.49■■■■■ 4.23
NIT1-216ENST00000496861 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.43■■■■■ 4.22
NIT1-216ENST00000496861 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.34■■■■■ 4.21
NIT1-216ENST00000496861 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.33■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms