RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519520.5

CHTF8-205, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHTF8, Length 856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF8-205ENST00000519520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.2■■■■■ 6.75
CHTF8-205ENST00000519520 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.11■■■■■ 5.77
CHTF8-205ENST00000519520 ABCC9O60706 1549 aa50.72■■■■■ 5.71
CHTF8-205ENST00000519520 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.49■■■■■ 5.35
CHTF8-205ENST00000519520 NACADO15069 1562 aa48.28■■■■■ 5.32
CHTF8-205ENST00000519520 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.11■■■■■ 5.29
CHTF8-205ENST00000519520 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.79■■■■■ 5.24
CHTF8-205ENST00000519520 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
CHTF8-205ENST00000519520 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.31■■■■■ 5.16
CHTF8-205ENST00000519520 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.3■■■■■ 5.16
CHTF8-205ENST00000519520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.25■■■■■ 5.15
CHTF8-205ENST00000519520 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.2■■■■■ 5.15
CHTF8-205ENST00000519520 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.01■■■■■ 5.12
CHTF8-205ENST00000519520 SCRIBQ14160 1630 aa46.57■■■■■ 5.05
CHTF8-205ENST00000519520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.54■■■■■ 5.04
CHTF8-205ENST00000519520 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
CHTF8-205ENST00000519520 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.82■■■■■ 4.93
CHTF8-205ENST00000519520 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.68■■■■■ 4.9
CHTF8-205ENST00000519520 NCAPD3P42695 1498 aa44.59■■■■■ 4.73
CHTF8-205ENST00000519520 SMARCA4P51532 1647 aa44.5■■■■■ 4.71
CHTF8-205ENST00000519520 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.48■■■■■ 4.71
CHTF8-205ENST00000519520 SMARCA2P51531 1590 aa44.39■■■■■ 4.7
CHTF8-205ENST00000519520 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
CHTF8-205ENST00000519520 HMGXB3Q12766 1538 aa44.27■■■■■ 4.68
CHTF8-205ENST00000519520 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.11■■■■■ 4.65
CHTF8-205ENST00000519520 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
CHTF8-205ENST00000519520 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.05■■■■■ 4.64
CHTF8-205ENST00000519520 ERCC6Q03468 1493 aa43.8■■■■■ 4.6
CHTF8-205ENST00000519520 NESP48681 1621 aa43.67■■■■■ 4.58
CHTF8-205ENST00000519520 CUX2O14529 1486 aa43.59■■■■■ 4.57
CHTF8-205ENST00000519520 WIZO95785 1651 aa43.5■■■■■ 4.55
CHTF8-205ENST00000519520 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.48■■■■■ 4.55
CHTF8-205ENST00000519520 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
CHTF8-205ENST00000519520 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.26■■■■■ 4.52
CHTF8-205ENST00000519520 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.26■■■■■ 4.52
CHTF8-205ENST00000519520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
CHTF8-205ENST00000519520 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.1■■■■■ 4.49
CHTF8-205ENST00000519520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.07■■■■■ 4.49
CHTF8-205ENST00000519520 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
CHTF8-205ENST00000519520 CFTRP13569 1480 aa42.84■■■■■ 4.45
CHTF8-205ENST00000519520 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.82■■■■■ 4.45
CHTF8-205ENST00000519520 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.74■■■■■ 4.43
CHTF8-205ENST00000519520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.74■■■■■ 4.43
CHTF8-205ENST00000519520 WDR62O43379 1518 aa42.7■■■■■ 4.43
CHTF8-205ENST00000519520 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.55■■■■■ 4.4
CHTF8-205ENST00000519520 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
CHTF8-205ENST00000519520 PRDM2Q13029 1718 aa42.32■■■■■ 4.36
CHTF8-205ENST00000519520 TOPBP1Q92547 1522 aa41.96■■■■■ 4.31
CHTF8-205ENST00000519520 ABCC8Q09428 1581 aa41.95■■■■■ 4.31
CHTF8-205ENST00000519520 IFT140Q96RY7 1462 aa41.89■■■■■ 4.3
CHTF8-205ENST00000519520 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.84■■■■■ 4.29
CHTF8-205ENST00000519520 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
CHTF8-205ENST00000519520 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
CHTF8-205ENST00000519520 OSCARQ8IYS5 282 aa41.7■■■■■ 4.27
CHTF8-205ENST00000519520 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
CHTF8-205ENST00000519520 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
CHTF8-205ENST00000519520 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
CHTF8-205ENST00000519520 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.42■■■■■ 4.22
CHTF8-205ENST00000519520 SOGA1O94964 1423 aa41.4■■■■■ 4.22
CHTF8-205ENST00000519520 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.39■■■■■ 4.22
CHTF8-205ENST00000519520 CUX1P39880 1505 aa41.37■■■■■ 4.21
CHTF8-205ENST00000519520 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.35■■■■■ 4.21
CHTF8-205ENST00000519520 TRIM41Q8WV44 630 aa41.35■■■■■ 4.21
CHTF8-205ENST00000519520 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
CHTF8-205ENST00000519520 WDR97A6NE52 1622 aa41.19■■■■■ 4.18
CHTF8-205ENST00000519520 FBLN2P98095 1184 aa41.09■■■■■ 4.17
CHTF8-205ENST00000519520 CHD1O14646 1710 aa41.06■■■■■ 4.16
CHTF8-205ENST00000519520 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.02■■■■■ 4.16
CHTF8-205ENST00000519520 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41■■■■■ 4.15
CHTF8-205ENST00000519520 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41■■■■■ 4.15
CHTF8-205ENST00000519520 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41■■■■■ 4.15
CHTF8-205ENST00000519520 GRIN2BQ13224 1484 aa41■■■■■ 4.15
CHTF8-205ENST00000519520 ARHGEF11O15085 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
CHTF8-205ENST00000519520 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
CHTF8-205ENST00000519520 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.93■■■■■ 4.14
CHTF8-205ENST00000519520 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.9■■■■■ 4.14
CHTF8-205ENST00000519520 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
CHTF8-205ENST00000519520 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
CHTF8-205ENST00000519520 TOP2BQ02880 1626 aa40.82■■■■■ 4.13
CHTF8-205ENST00000519520 SYNJ2O15056 1496 aa40.82■■■■■ 4.12
CHTF8-205ENST00000519520 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.8■■■■■ 4.12
CHTF8-205ENST00000519520 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.78■■■■■ 4.12
CHTF8-205ENST00000519520 PBRM1Q86U86 1689 aa40.76■■■■■ 4.12
CHTF8-205ENST00000519520 SYNJ1O43426 1573 aa40.76■■■■■ 4.12
CHTF8-205ENST00000519520 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.68■■■■■ 4.1
CHTF8-205ENST00000519520 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.67■■■■■ 4.1
CHTF8-205ENST00000519520 ARAP1Q96P48 1450 aa40.59■■■■■ 4.09
CHTF8-205ENST00000519520 GRIN2AQ12879 1464 aa40.45■■■■■ 4.07
CHTF8-205ENST00000519520 ADAMTS12P58397 1594 aa40.45■■■■■ 4.07
CHTF8-205ENST00000519520 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.43■■■■■ 4.06
CHTF8-205ENST00000519520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.42■■■■■ 4.06
CHTF8-205ENST00000519520 NUP160Q12769 1436 aa40.32■■■■■ 4.04
CHTF8-205ENST00000519520 CEP170Q5SW79 1584 aa40.25■■■■■ 4.03
CHTF8-205ENST00000519520 KIF27Q86VH2 1401 aa40.1■■■■■ 4.01
CHTF8-205ENST00000519520 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
CHTF8-205ENST00000519520 SHROOM2Q13796 1616 aa40.05■■■■■ 4
CHTF8-205ENST00000519520 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.04■■■■■ 4
CHTF8-205ENST00000519520 IGF1RP08069 1367 aa40.02■■■■■ 4
CHTF8-205ENST00000519520 JPH4Q96JJ6 628 aa39.93■■■■□ 3.98
CHTF8-205ENST00000519520 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
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