RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522497.1

CHTF8-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF8, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF8-209ENST00000522497 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.69■■■■■ 7.15
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CHTF8-209ENST00000522497 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.71■■■■■ 5.71
CHTF8-209ENST00000522497 NACADO15069 1562 aa50.43■■■■■ 5.66
CHTF8-209ENST00000522497 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.39■■■■■ 5.66
CHTF8-209ENST00000522497 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.83■■■■■ 5.57
CHTF8-209ENST00000522497 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.68■■■■■ 5.54
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CHTF8-209ENST00000522497 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.49■■■■■ 5.51
CHTF8-209ENST00000522497 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.3■■■■■ 5.48
CHTF8-209ENST00000522497 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.21■■■■■ 5.47
CHTF8-209ENST00000522497 SCRIBQ14160 1630 aa48.68■■■■■ 5.38
CHTF8-209ENST00000522497 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.57■■■■■ 5.37
CHTF8-209ENST00000522497 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.01■■■■■ 5.28
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CHTF8-209ENST00000522497 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.86■■■■■ 5.25
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CHTF8-209ENST00000522497 SMARCA2P51531 1590 aa46.35■■■■■ 5.01
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CHTF8-209ENST00000522497 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.01■■■■■ 4.96
CHTF8-209ENST00000522497 ERCC6Q03468 1493 aa45.88■■■■■ 4.94
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CHTF8-209ENST00000522497 CUX2O14529 1486 aa45.68■■■■■ 4.9
CHTF8-209ENST00000522497 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.45■■■■■ 4.87
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CHTF8-209ENST00000522497 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.41■■■■■ 4.86
CHTF8-209ENST00000522497 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.24■■■■■ 4.83
CHTF8-209ENST00000522497 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.21■■■■■ 4.83
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CHTF8-209ENST00000522497 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
CHTF8-209ENST00000522497 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.11■■■■■ 4.81
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CHTF8-209ENST00000522497 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.79■■■■■ 4.76
CHTF8-209ENST00000522497 CFTRP13569 1480 aa44.72■■■■■ 4.75
CHTF8-209ENST00000522497 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.67■■■■■ 4.74
CHTF8-209ENST00000522497 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.66■■■■■ 4.74
CHTF8-209ENST00000522497 WDR62O43379 1518 aa44.65■■■■■ 4.74
CHTF8-209ENST00000522497 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.42■■■■■ 4.7
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CHTF8-209ENST00000522497 PRDM2Q13029 1718 aa44.19■■■■■ 4.67
CHTF8-209ENST00000522497 TOPBP1Q92547 1522 aa43.84■■■■■ 4.61
CHTF8-209ENST00000522497 ABCC8Q09428 1581 aa43.8■■■■■ 4.6
CHTF8-209ENST00000522497 IFT140Q96RY7 1462 aa43.78■■■■■ 4.6
CHTF8-209ENST00000522497 OSCARQ8IYS5 282 aa43.75■■■■■ 4.59
CHTF8-209ENST00000522497 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.69■■■■■ 4.58
CHTF8-209ENST00000522497 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
CHTF8-209ENST00000522497 TRIM41Q8WV44 630 aa43.55■■■■■ 4.56
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CHTF8-209ENST00000522497 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.36■■■■■ 4.53
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CHTF8-209ENST00000522497 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.27■■■■■ 4.52
CHTF8-209ENST00000522497 CUX1P39880 1505 aa43.19■■■■■ 4.5
CHTF8-209ENST00000522497 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.19■■■■■ 4.5
CHTF8-209ENST00000522497 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
CHTF8-209ENST00000522497 FBLN2P98095 1184 aa43.08■■■■■ 4.49
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CHTF8-209ENST00000522497 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
CHTF8-209ENST00000522497 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
CHTF8-209ENST00000522497 CHD1O14646 1710 aa43.02■■■■■ 4.48
CHTF8-209ENST00000522497 WDR97A6NE52 1622 aa42.97■■■■■ 4.47
CHTF8-209ENST00000522497 ARHGEF11O15085 1522 aa42.94■■■■■ 4.46
CHTF8-209ENST00000522497 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.88■■■■■ 4.46
CHTF8-209ENST00000522497 GRIN2BQ13224 1484 aa42.84■■■■■ 4.45
CHTF8-209ENST00000522497 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
CHTF8-209ENST00000522497 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
CHTF8-209ENST00000522497 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.73■■■■■ 4.43
CHTF8-209ENST00000522497 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.71■■■■■ 4.43
CHTF8-209ENST00000522497 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.71■■■■■ 4.43
CHTF8-209ENST00000522497 SYNJ2O15056 1496 aa42.65■■■■■ 4.42
CHTF8-209ENST00000522497 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.63■■■■■ 4.42
CHTF8-209ENST00000522497 PBRM1Q86U86 1689 aa42.6■■■■■ 4.41
CHTF8-209ENST00000522497 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.58■■■■■ 4.41
CHTF8-209ENST00000522497 SYNJ1O43426 1573 aa42.57■■■■■ 4.41
CHTF8-209ENST00000522497 TOP2BQ02880 1626 aa42.57■■■■■ 4.4
CHTF8-209ENST00000522497 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.56■■■■■ 4.4
CHTF8-209ENST00000522497 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.54■■■■■ 4.4
CHTF8-209ENST00000522497 ARAP1Q96P48 1450 aa42.54■■■■■ 4.4
CHTF8-209ENST00000522497 GRIN2AQ12879 1464 aa42.27■■■■■ 4.36
CHTF8-209ENST00000522497 ADAMTS12P58397 1594 aa42.24■■■■■ 4.35
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CHTF8-209ENST00000522497 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.17■■■■■ 4.34
CHTF8-209ENST00000522497 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
CHTF8-209ENST00000522497 NUP160Q12769 1436 aa42.12■■■■■ 4.33
CHTF8-209ENST00000522497 CEP170Q5SW79 1584 aa42.08■■■■■ 4.33
CHTF8-209ENST00000522497 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.93■■■■■ 4.3
CHTF8-209ENST00000522497 SHROOM2Q13796 1616 aa41.86■■■■■ 4.29
CHTF8-209ENST00000522497 KIF27Q86VH2 1401 aa41.8■■■■■ 4.28
CHTF8-209ENST00000522497 IGF1RP08069 1367 aa41.78■■■■■ 4.28
CHTF8-209ENST00000522497 JPH4Q96JJ6 628 aa41.77■■■■■ 4.28
CHTF8-209ENST00000522497 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
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