Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PCGF2P35227 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCGF2P35227 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF2P35227 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF2P35227 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms