Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHMLP26374 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHMLP26374 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHMLP26374 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHMLP26374 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHMLP26374 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHMLP26374 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHMLP26374 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHMLP26374 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHMLP26374 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHMLP26374 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CHMLP26374 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHMLP26374 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHMLP26374 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHMLP26374 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHMLP26374 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHMLP26374 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHMLP26374 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHMLP26374 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHMLP26374 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHMLP26374 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHMLP26374 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHMLP26374 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHMLP26374 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMLP26374 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMLP26374 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMLP26374 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMLP26374 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMLP26374 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHMLP26374 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHMLP26374 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHMLP26374 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHMLP26374 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHMLP26374 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHMLP26374 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CHMLP26374 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMLP26374 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMLP26374 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMLP26374 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMLP26374 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMLP26374 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMLP26374 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMLP26374 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMLP26374 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMLP26374 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMLP26374 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHMLP26374 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CHMLP26374 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHMLP26374 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CHMLP26374 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMLP26374 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMLP26374 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMLP26374 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMLP26374 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMLP26374 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMLP26374 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMLP26374 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMLP26374 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMLP26374 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHMLP26374 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMLP26374 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMLP26374 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHMLP26374 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMLP26374 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHMLP26374 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMLP26374 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMLP26374 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMLP26374 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMLP26374 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMLP26374 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMLP26374 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMLP26374 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMLP26374 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMLP26374 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHMLP26374 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHMLP26374 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHMLP26374 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHMLP26374 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMLP26374 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMLP26374 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMLP26374 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
CHMLP26374 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHMLP26374 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CHMLP26374 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHMLP26374 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHMLP26374 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHMLP26374 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHMLP26374 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHMLP26374 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHMLP26374 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHMLP26374 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CHMLP26374 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CHMLP26374 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHMLP26374 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHMLP26374 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHMLP26374 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CHMLP26374 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHMLP26374 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHMLP26374 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHMLP26374 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms