Protein–RNA interactions for Protein: P17936

IGFBP3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFBP3P17936 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGFBP3P17936 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGFBP3P17936 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGFBP3P17936 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGFBP3P17936 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGFBP3P17936 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms