Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLUP10909 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLUP10909 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLUP10909 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLUP10909 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLUP10909 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLUP10909 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLUP10909 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLUP10909 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLUP10909 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLUP10909 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLUP10909 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLUP10909 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLUP10909 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLUP10909 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLUP10909 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLUP10909 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLUP10909 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLUP10909 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLUP10909 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLUP10909 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLUP10909 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLUP10909 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLUP10909 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLUP10909 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLUP10909 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLUP10909 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLUP10909 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLUP10909 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLUP10909 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLUP10909 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLUP10909 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLUP10909 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLUP10909 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLUP10909 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLUP10909 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLUP10909 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLUP10909 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLUP10909 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLUP10909 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLUP10909 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLUP10909 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLUP10909 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLUP10909 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLUP10909 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLUP10909 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLUP10909 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLUP10909 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLUP10909 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLUP10909 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLUP10909 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLUP10909 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLUP10909 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLUP10909 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLUP10909 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLUP10909 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLUP10909 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLUP10909 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLUP10909 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLUP10909 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLUP10909 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLUP10909 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLUP10909 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLUP10909 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLUP10909 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLUP10909 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLUP10909 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLUP10909 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLUP10909 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLUP10909 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLUP10909 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLUP10909 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLUP10909 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLUP10909 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLUP10909 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLUP10909 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLUP10909 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLUP10909 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLUP10909 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLUP10909 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLUP10909 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLUP10909 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLUP10909 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLUP10909 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLUP10909 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLUP10909 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLUP10909 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLUP10909 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLUP10909 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLUP10909 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLUP10909 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLUP10909 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLUP10909 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLUP10909 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLUP10909 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLUP10909 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLUP10909 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLUP10909 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLUP10909 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLUP10909 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms