Protein–RNA interactions for Protein: P07996

THBS1, Thrombospondin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1P07996 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THBS1P07996 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THBS1P07996 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS1P07996 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS1P07996 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS1P07996 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS1P07996 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS1P07996 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS1P07996 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS1P07996 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS1P07996 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS1P07996 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THBS1P07996 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THBS1P07996 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THBS1P07996 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THBS1P07996 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THBS1P07996 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THBS1P07996 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THBS1P07996 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS1P07996 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS1P07996 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS1P07996 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS1P07996 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS1P07996 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THBS1P07996 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS1P07996 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS1P07996 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THBS1P07996 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THBS1P07996 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THBS1P07996 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THBS1P07996 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS1P07996 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS1P07996 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS1P07996 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS1P07996 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THBS1P07996 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THBS1P07996 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS1P07996 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS1P07996 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS1P07996 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS1P07996 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS1P07996 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THBS1P07996 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THBS1P07996 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THBS1P07996 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THBS1P07996 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THBS1P07996 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS1P07996 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS1P07996 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS1P07996 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS1P07996 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS1P07996 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS1P07996 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THBS1P07996 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THBS1P07996 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THBS1P07996 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
THBS1P07996 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
THBS1P07996 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS1P07996 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS1P07996 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS1P07996 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS1P07996 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS1P07996 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS1P07996 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS1P07996 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS1P07996 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THBS1P07996 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THBS1P07996 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS1P07996 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS1P07996 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS1P07996 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THBS1P07996 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS1P07996 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS1P07996 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS1P07996 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS1P07996 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS1P07996 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS1P07996 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS1P07996 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS1P07996 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THBS1P07996 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THBS1P07996 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THBS1P07996 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THBS1P07996 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THBS1P07996 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THBS1P07996 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS1P07996 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS1P07996 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS1P07996 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS1P07996 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THBS1P07996 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS1P07996 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS1P07996 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS1P07996 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS1P07996 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS1P07996 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THBS1P07996 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THBS1P07996 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THBS1P07996 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THBS1P07996 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms