Protein–RNA interactions for Protein: P07996

THBS1, Thrombospondin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1P07996 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
THBS1P07996 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
THBS1P07996 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
THBS1P07996 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
THBS1P07996 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
THBS1P07996 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
THBS1P07996 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
THBS1P07996 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
THBS1P07996 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
THBS1P07996 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
THBS1P07996 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
THBS1P07996 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
THBS1P07996 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
THBS1P07996 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THBS1P07996 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THBS1P07996 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
THBS1P07996 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
THBS1P07996 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
THBS1P07996 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
THBS1P07996 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THBS1P07996 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THBS1P07996 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THBS1P07996 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THBS1P07996 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THBS1P07996 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
THBS1P07996 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
THBS1P07996 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
THBS1P07996 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THBS1P07996 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THBS1P07996 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THBS1P07996 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
THBS1P07996 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
THBS1P07996 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
THBS1P07996 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
THBS1P07996 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THBS1P07996 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THBS1P07996 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THBS1P07996 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THBS1P07996 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THBS1P07996 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THBS1P07996 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
THBS1P07996 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
THBS1P07996 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
THBS1P07996 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THBS1P07996 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THBS1P07996 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THBS1P07996 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THBS1P07996 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THBS1P07996 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THBS1P07996 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
THBS1P07996 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THBS1P07996 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THBS1P07996 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THBS1P07996 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THBS1P07996 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THBS1P07996 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THBS1P07996 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THBS1P07996 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THBS1P07996 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THBS1P07996 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THBS1P07996 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THBS1P07996 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THBS1P07996 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THBS1P07996 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THBS1P07996 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THBS1P07996 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THBS1P07996 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THBS1P07996 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THBS1P07996 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
THBS1P07996 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THBS1P07996 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THBS1P07996 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THBS1P07996 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THBS1P07996 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
THBS1P07996 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THBS1P07996 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
THBS1P07996 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THBS1P07996 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
THBS1P07996 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
THBS1P07996 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
THBS1P07996 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THBS1P07996 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THBS1P07996 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THBS1P07996 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
THBS1P07996 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THBS1P07996 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THBS1P07996 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THBS1P07996 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THBS1P07996 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THBS1P07996 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THBS1P07996 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THBS1P07996 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
THBS1P07996 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
THBS1P07996 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THBS1P07996 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THBS1P07996 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THBS1P07996 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THBS1P07996 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THBS1P07996 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THBS1P07996 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms