Protein–RNA interactions for Protein: P06028

GYPB, Glycophorin-B, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPBP06028 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GYPBP06028 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GYPBP06028 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GYPBP06028 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GYPBP06028 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GYPBP06028 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GYPBP06028 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GYPBP06028 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GYPBP06028 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GYPBP06028 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GYPBP06028 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GYPBP06028 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GYPBP06028 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GYPBP06028 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GYPBP06028 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GYPBP06028 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GYPBP06028 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GYPBP06028 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GYPBP06028 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GYPBP06028 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GYPBP06028 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GYPBP06028 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GYPBP06028 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GYPBP06028 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GYPBP06028 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GYPBP06028 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GYPBP06028 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GYPBP06028 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GYPBP06028 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GYPBP06028 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GYPBP06028 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GYPBP06028 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GYPBP06028 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GYPBP06028 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GYPBP06028 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GYPBP06028 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GYPBP06028 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GYPBP06028 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GYPBP06028 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GYPBP06028 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GYPBP06028 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GYPBP06028 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GYPBP06028 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GYPBP06028 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GYPBP06028 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GYPBP06028 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GYPBP06028 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GYPBP06028 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GYPBP06028 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GYPBP06028 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GYPBP06028 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GYPBP06028 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GYPBP06028 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GYPBP06028 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GYPBP06028 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GYPBP06028 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GYPBP06028 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GYPBP06028 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GYPBP06028 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYPBP06028 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYPBP06028 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYPBP06028 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPBP06028 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPBP06028 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPBP06028 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPBP06028 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPBP06028 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPBP06028 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYPBP06028 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYPBP06028 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPBP06028 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPBP06028 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPBP06028 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPBP06028 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPBP06028 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPBP06028 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPBP06028 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPBP06028 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPBP06028 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPBP06028 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPBP06028 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPBP06028 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPBP06028 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPBP06028 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPBP06028 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GYPBP06028 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPBP06028 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPBP06028 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPBP06028 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPBP06028 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPBP06028 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPBP06028 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPBP06028 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPBP06028 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPBP06028 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPBP06028 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPBP06028 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPBP06028 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPBP06028 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPBP06028 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms