Protein–RNA interactions for Protein: P06028

GYPB, Glycophorin-B, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPBP06028 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GYPBP06028 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GYPBP06028 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GYPBP06028 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GYPBP06028 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GYPBP06028 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GYPBP06028 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GYPBP06028 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GYPBP06028 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GYPBP06028 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GYPBP06028 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GYPBP06028 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GYPBP06028 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GYPBP06028 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GYPBP06028 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GYPBP06028 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GYPBP06028 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GYPBP06028 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GYPBP06028 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GYPBP06028 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GYPBP06028 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GYPBP06028 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GYPBP06028 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GYPBP06028 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GYPBP06028 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYPBP06028 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GYPBP06028 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GYPBP06028 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GYPBP06028 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GYPBP06028 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GYPBP06028 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GYPBP06028 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GYPBP06028 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GYPBP06028 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GYPBP06028 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GYPBP06028 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GYPBP06028 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GYPBP06028 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GYPBP06028 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GYPBP06028 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GYPBP06028 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GYPBP06028 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GYPBP06028 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GYPBP06028 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GYPBP06028 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GYPBP06028 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GYPBP06028 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GYPBP06028 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GYPBP06028 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GYPBP06028 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GYPBP06028 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GYPBP06028 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GYPBP06028 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GYPBP06028 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GYPBP06028 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GYPBP06028 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GYPBP06028 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GYPBP06028 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GYPBP06028 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GYPBP06028 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GYPBP06028 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GYPBP06028 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GYPBP06028 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GYPBP06028 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GYPBP06028 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GYPBP06028 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GYPBP06028 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GYPBP06028 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GYPBP06028 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GYPBP06028 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GYPBP06028 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GYPBP06028 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GYPBP06028 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GYPBP06028 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GYPBP06028 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GYPBP06028 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GYPBP06028 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GYPBP06028 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GYPBP06028 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GYPBP06028 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPBP06028 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GYPBP06028 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYPBP06028 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GYPBP06028 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYPBP06028 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYPBP06028 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPBP06028 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPBP06028 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYPBP06028 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GYPBP06028 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYPBP06028 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GYPBP06028 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GYPBP06028 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYPBP06028 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GYPBP06028 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GYPBP06028 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GYPBP06028 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GYPBP06028 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYPBP06028 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYPBP06028 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms