Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GASTP01350 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GASTP01350 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GASTP01350 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GASTP01350 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GASTP01350 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GASTP01350 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GASTP01350 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GASTP01350 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GASTP01350 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GASTP01350 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GASTP01350 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GASTP01350 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GASTP01350 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GASTP01350 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GASTP01350 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GASTP01350 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GASTP01350 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GASTP01350 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GASTP01350 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GASTP01350 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GASTP01350 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GASTP01350 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GASTP01350 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GASTP01350 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GASTP01350 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GASTP01350 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GASTP01350 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GASTP01350 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GASTP01350 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GASTP01350 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GASTP01350 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GASTP01350 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GASTP01350 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GASTP01350 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GASTP01350 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GASTP01350 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GASTP01350 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GASTP01350 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GASTP01350 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GASTP01350 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GASTP01350 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GASTP01350 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GASTP01350 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GASTP01350 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GASTP01350 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GASTP01350 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GASTP01350 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GASTP01350 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GASTP01350 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GASTP01350 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GASTP01350 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GASTP01350 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GASTP01350 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GASTP01350 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GASTP01350 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GASTP01350 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GASTP01350 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GASTP01350 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GASTP01350 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GASTP01350 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GASTP01350 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GASTP01350 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GASTP01350 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GASTP01350 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GASTP01350 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GASTP01350 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GASTP01350 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GASTP01350 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GASTP01350 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GASTP01350 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GASTP01350 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GASTP01350 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GASTP01350 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GASTP01350 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GASTP01350 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GASTP01350 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GASTP01350 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GASTP01350 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GASTP01350 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GASTP01350 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GASTP01350 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GASTP01350 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GASTP01350 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GASTP01350 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GASTP01350 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GASTP01350 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GASTP01350 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GASTP01350 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GASTP01350 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GASTP01350 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GASTP01350 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GASTP01350 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GASTP01350 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GASTP01350 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GASTP01350 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GASTP01350 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GASTP01350 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GASTP01350 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GASTP01350 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms