Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GASTP01350 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GASTP01350 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GASTP01350 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GASTP01350 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GASTP01350 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GASTP01350 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GASTP01350 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GASTP01350 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GASTP01350 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GASTP01350 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GASTP01350 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GASTP01350 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GASTP01350 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GASTP01350 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GASTP01350 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GASTP01350 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GASTP01350 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GASTP01350 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GASTP01350 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GASTP01350 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GASTP01350 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GASTP01350 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GASTP01350 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GASTP01350 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GASTP01350 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GASTP01350 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GASTP01350 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GASTP01350 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GASTP01350 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GASTP01350 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GASTP01350 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GASTP01350 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GASTP01350 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GASTP01350 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GASTP01350 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GASTP01350 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GASTP01350 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GASTP01350 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GASTP01350 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GASTP01350 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GASTP01350 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GASTP01350 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GASTP01350 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GASTP01350 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GASTP01350 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GASTP01350 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GASTP01350 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GASTP01350 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GASTP01350 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GASTP01350 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GASTP01350 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GASTP01350 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GASTP01350 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GASTP01350 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GASTP01350 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GASTP01350 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GASTP01350 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GASTP01350 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GASTP01350 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GASTP01350 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GASTP01350 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GASTP01350 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GASTP01350 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GASTP01350 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GASTP01350 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GASTP01350 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GASTP01350 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GASTP01350 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GASTP01350 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GASTP01350 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GASTP01350 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GASTP01350 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GASTP01350 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GASTP01350 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GASTP01350 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GASTP01350 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GASTP01350 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GASTP01350 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GASTP01350 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GASTP01350 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GASTP01350 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GASTP01350 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GASTP01350 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GASTP01350 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GASTP01350 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GASTP01350 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GASTP01350 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GASTP01350 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GASTP01350 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GASTP01350 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GASTP01350 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GASTP01350 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GASTP01350 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GASTP01350 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GASTP01350 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GASTP01350 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GASTP01350 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GASTP01350 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GASTP01350 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms