Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT4O95628 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT4O95628 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT4O95628 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT4O95628 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms