Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOFO60613 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOFO60613 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOFO60613 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.8 ms