Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BNIP3LO60238 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3LO60238 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3LO60238 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3LO60238 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3LO60238 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3LO60238 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BNIP3LO60238 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNIP3LO60238 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNIP3LO60238 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNIP3LO60238 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP3LO60238 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms