Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PJA2O43164 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PJA2O43164 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PJA2O43164 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PJA2O43164 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PJA2O43164 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PJA2O43164 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PJA2O43164 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PJA2O43164 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PJA2O43164 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PJA2O43164 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PJA2O43164 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PJA2O43164 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PJA2O43164 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PJA2O43164 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PJA2O43164 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PJA2O43164 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PJA2O43164 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PJA2O43164 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PJA2O43164 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PJA2O43164 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PJA2O43164 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PJA2O43164 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PJA2O43164 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PJA2O43164 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA2O43164 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA2O43164 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA2O43164 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PJA2O43164 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PJA2O43164 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PJA2O43164 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PJA2O43164 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PJA2O43164 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PJA2O43164 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PJA2O43164 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PJA2O43164 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PJA2O43164 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PJA2O43164 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PJA2O43164 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PJA2O43164 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PJA2O43164 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PJA2O43164 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PJA2O43164 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PJA2O43164 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA2O43164 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA2O43164 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA2O43164 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA2O43164 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA2O43164 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA2O43164 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA2O43164 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA2O43164 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA2O43164 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA2O43164 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA2O43164 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PJA2O43164 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PJA2O43164 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PJA2O43164 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PJA2O43164 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PJA2O43164 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PJA2O43164 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PJA2O43164 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PJA2O43164 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PJA2O43164 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PJA2O43164 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PJA2O43164 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PJA2O43164 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PJA2O43164 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PJA2O43164 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PJA2O43164 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PJA2O43164 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA2O43164 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA2O43164 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA2O43164 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA2O43164 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PJA2O43164 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PJA2O43164 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PJA2O43164 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PJA2O43164 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PJA2O43164 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PJA2O43164 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PJA2O43164 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PJA2O43164 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PJA2O43164 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PJA2O43164 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PJA2O43164 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PJA2O43164 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PJA2O43164 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PJA2O43164 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PJA2O43164 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PJA2O43164 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PJA2O43164 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PJA2O43164 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PJA2O43164 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA2O43164 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA2O43164 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA2O43164 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA2O43164 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA2O43164 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA2O43164 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms