Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC154A6NI56 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC154A6NI56 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC154A6NI56 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC154A6NI56 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms