Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA6L4A6NEF3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GOLGA6L4A6NEF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms