Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0T9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0T9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087X0T9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087X0T9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms