Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
A0A087X0T9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
A0A087X0T9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
A0A087X0T9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
A0A087X0T9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
A0A087X0T9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
A0A087X0T9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
A0A087X0T9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
A0A087X0T9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
A0A087X0T9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
A0A087X0T9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
A0A087X0T9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
A0A087X0T9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
A0A087X0T9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
A0A087X0T9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
A0A087X0T9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
A0A087X0T9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
A0A087X0T9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
A0A087X0T9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
A0A087X0T9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
A0A087X0T9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
A0A087X0T9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
A0A087X0T9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
A0A087X0T9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
A0A087X0T9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
A0A087X0T9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
A0A087X0T9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
A0A087X0T9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
A0A087X0T9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
A0A087X0T9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
A0A087X0T9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
A0A087X0T9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
A0A087X0T9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
A0A087X0T9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
A0A087X0T9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
A0A087X0T9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
A0A087X0T9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
A0A087X0T9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
A0A087X0T9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
A0A087X0T9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
A0A087X0T9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
A0A087X0T9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
A0A087X0T9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
A0A087X0T9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
A0A087X0T9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
A0A087X0T9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
A0A087X0T9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
A0A087X0T9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
A0A087X0T9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
A0A087X0T9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
A0A087X0T9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
A0A087X0T9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
A0A087X0T9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
A0A087X0T9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
A0A087X0T9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
A0A087X0T9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
A0A087X0T9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
A0A087X0T9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
A0A087X0T9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
A0A087X0T9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
A0A087X0T9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
A0A087X0T9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
A0A087X0T9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
A0A087X0T9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
A0A087X0T9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
A0A087X0T9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
A0A087X0T9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
A0A087X0T9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
A0A087X0T9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
A0A087X0T9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
A0A087X0T9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
A0A087X0T9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
A0A087X0T9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
A0A087X0T9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
A0A087X0T9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
A0A087X0T9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
A0A087X0T9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
A0A087X0T9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
A0A087X0T9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
A0A087X0T9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
A0A087X0T9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
A0A087X0T9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
A0A087X0T9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
A0A087X0T9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
A0A087X0T9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
A0A087X0T9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
A0A087X0T9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
A0A087X0T9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
A0A087X0T9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
A0A087X0T9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
A0A087X0T9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
A0A087X0T9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
A0A087X0T9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
A0A087X0T9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
A0A087X0T9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
A0A087X0T9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
A0A087X0T9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
A0A087X0T9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
A0A087X0T9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
A0A087X0T9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms