Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 FTSJ3-212ENST00000583202 908 ntTSL 37.63□□□□□ -1.194e-6■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 NADK-212ENST00000492768 859 ntTSL 324.09■■□□□ 1.451e-10■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 SYTL1-206ENST00000490170 2681 ntTSL 220.74■□□□□ 0.911e-10■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.521e-13■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 SYTL1-207ENST00000496001 876 ntTSL 518.12■□□□□ 0.491e-10■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 SYTL1-205ENST00000485269 895 ntTSL 518.06■□□□□ 0.481e-10■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-207ENST00000558777 2139 ntTSL 217.9■□□□□ 0.462e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-208ENST00000560460 931 ntTSL 517.53■□□□□ 0.42e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-13■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 SPPL2B-210ENST00000614784 1411 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-211ENST00000560905 1008 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-206ENST00000558560 604 ntTSL 515.47■□□□□ 0.072e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 NADK-208ENST00000477235 1004 ntTSL 214.95□□□□□ -0.021e-10■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 NADK-213ENST00000492845 937 ntTSL 214.57□□□□□ -0.081e-10■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-13■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-205ENST00000558364 582 ntTSL 213.24□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 NADK-214ENST00000497186 683 ntTSL 312.85□□□□□ -0.351e-10■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 NADK-207ENST00000469045 890 ntTSL 512.85□□□□□ -0.351e-10■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-204ENST00000558232 1033 ntTSL 512.17□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 RMDN3-210ENST00000560779 572 ntTSL 312.17□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 QRICH1-212ENST00000498392 2362 ntTSL 211.7□□□□□ -0.541e-13■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 QRICH1-211ENST00000489642 1021 ntTSL 58.28□□□□□ -1.081e-13■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 QRICH1-209ENST00000477021 546 ntTSL 34.75□□□□□ -1.651e-13■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 QRICH1-208ENST00000469910 204 ntTSL 52.74□□□□□ -1.971e-13■■■■□ 26.6
SF3A3Q12874 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.764e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 HSF1-211ENST00000533130 493 ntTSL 313.73□□□□□ -0.212e-9■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 HSF1-213ENST00000534314 684 ntTSL 212.64□□□□□ -0.392e-9■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 HSF1-209ENST00000531447 364 ntTSL 212.57□□□□□ -0.42e-9■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 PSME4-206ENST00000476586 1422 ntTSL 1 (best)6.55□□□□□ -1.365e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 PSME4-209ENST00000488687 3073 ntTSL 26.29□□□□□ -1.45e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 PSME4-204ENST00000466539 548 ntTSL 45.81□□□□□ -1.485e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 NSFL1C-203ENST00000381653 1446 ntTSL 519.99■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 NSFL1C-213ENST00000555944 2588 ntTSL 219.32■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 NSFL1C-212ENST00000555568 863 ntTSL 315.2■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 NSFL1C-204ENST00000461211 3799 ntTSL 57.74□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 MYO5C-209ENST00000560809 6076 ntTSL 210.12□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.231e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 CROCCP3-206ENST00000591348 1695 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.911e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.68■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 LAMA5-214ENST00000497363 579 ntTSL 314.52□□□□□ -0.091e-44■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 212.5□□□□□ -0.414e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.75e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 HNRNPAB-203ENST00000504796 578 ntTSL 27.76□□□□□ -1.173e-11■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 DYNC1H1-208ENST00000556139 763 ntTSL 313.35□□□□□ -0.278e-7■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 26.5
SF3A3Q12874 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-8■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 PIDD1-205ENST00000527357 4496 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-8■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 PIDD1-204ENST00000525028 3175 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.012e-8■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 PIDD1-203ENST00000524486 3917 ntTSL 214.36□□□□□ -0.112e-8■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 PIDD1-210ENST00000534525 3994 ntTSL 214.09□□□□□ -0.152e-8■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 DUS1L-215ENST00000582529 1212 ntTSL 523.26■■□□□ 1.316e-7■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 DUS1L-208ENST00000578264 1071 ntTSL 515.34■□□□□ 0.056e-7■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.093e-7■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.863e-7■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 219.05■□□□□ 0.643e-7■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.513e-7■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 APOLD1-203ENST00000534843 2375 ntTSL 216.05■□□□□ 0.165e-11■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 DDX47-202ENST00000358007 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.675e-11■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 DDX47-206ENST00000541537 1517 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.845e-11■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 DDX47-212ENST00000545038 2357 ntTSL 1 (best)8.75□□□□□ -1.015e-11■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 DDX47-210ENST00000544400 597 ntTSL 36.03□□□□□ -1.445e-11■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.485e-11■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 DDX47-207ENST00000542123 2689 ntTSL 1 (best)3.5□□□□□ -1.855e-11■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 PIM3-202ENST00000467480 723 ntTSL 227.51■■□□□ 1.995e-8■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 INTS1-202ENST00000468115 3051 ntTSL 215.96■□□□□ 0.157e-7■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 TBC1D22A-211ENST00000496139 530 ntTSL 418.95■□□□□ 0.622e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 SAFB-206ENST00000589006 459 ntTSL 518.24■□□□□ 0.512e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 INF2-205ENST00000474229 947 ntTSL 317.88■□□□□ 0.452e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 TBC1D22A-210ENST00000486163 513 ntTSL 417.76■□□□□ 0.432e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 TBC1D22A-208ENST00000441936 590 ntTSL 417.29■□□□□ 0.362e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 AC010522.1-201ENST00000597134 540 ntTSL 317.05■□□□□ 0.322e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 FARP1-229ENST00000600190 566 ntTSL 316.92■□□□□ 0.32e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 STAMBP-205ENST00000424659 583 ntTSL 316.83■□□□□ 0.282e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 STK11-202ENST00000585465 3554 ntTSL 515.51■□□□□ 0.072e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 CAMK2G-209ENST00000441192 1224 ntTSL 513.78□□□□□ -0.22e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 TBC1D22A-209ENST00000472791 558 ntTSL 413.34□□□□□ -0.272e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 MRPL38-217ENST00000588620 498 ntTSL 311.46□□□□□ -0.572e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 MRPL38-207ENST00000477023 446 ntTSL 310.5□□□□□ -0.732e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 STAMBP-207ENST00000452725 560 ntTSL 410.12□□□□□ -0.792e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 CAMK2G-211ENST00000474131 512 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.842e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 MRPL38-211ENST00000483393 525 ntTSL 28.52□□□□□ -1.052e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 MRPL38-210ENST00000480203 534 ntTSL 37.35□□□□□ -1.232e-10■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 PYGL-207ENST00000553872 746 ntTSL 58.1□□□□□ -1.117e-23■■■■□ 26.4
SF3A3Q12874 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 26.3
SF3A3Q12874 FASN-203ENST00000579410 424 ntTSL 28.12□□□□□ -1.114e-12■■■■□ 26.3
SF3A3Q12874 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.362e-6■■■■□ 26.3
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