Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.913e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.835e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.749e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.725e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.689e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-213ENST00000539458 565 ntTSL 519■□□□□ 0.635e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.629e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.615e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.583e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 LGMN-217ENST00000557609 1832 ntTSL 518.61■□□□□ 0.579e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 LGMN-210ENST00000555169 543 ntTSL 218.39■□□□□ 0.539e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 GANAB-206ENST00000526392 257 ntTSL 318.34■□□□□ 0.533e-11■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-221ENST00000544377 589 ntTSL 418.23■□□□□ 0.515e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.59e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 GANAB-205ENST00000526210 533 ntTSL 417.32■□□□□ 0.363e-11■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.343e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.323e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 GANAB-204ENST00000525994 390 ntTSL 417■□□□□ 0.313e-11■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-216ENST00000541372 269 ntTSL 516.85■□□□□ 0.295e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PRKCSH-204ENST00000587290 780 ntTSL 216.61■□□□□ 0.253e-11■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-211ENST00000538084 741 ntTSL 316.24■□□□□ 0.195e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 FADS2-204ENST00000517312 588 ntTSL 515.3■□□□□ 0.043e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 GANAB-209ENST00000529737 577 ntTSL 414.47□□□□□ -0.093e-11■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RDH11-207ENST00000554731 888 ntTSL 313.63□□□□□ -0.239e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 LGMN-219ENST00000557725 741 ntTSL 212.65□□□□□ -0.389e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 FADS2-207ENST00000520145 428 ntTSL 311.77□□□□□ -0.539e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RDH11-202ENST00000428130 1064 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.629e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.639e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RDH11-209ENST00000557273 562 ntTSL 311.05□□□□□ -0.649e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PRKCSH-215ENST00000592435 358 ntTSL 510.6□□□□□ -0.713e-11■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RDH11-206ENST00000554035 849 ntTSL 39.98□□□□□ -0.819e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RDH11-205ENST00000553816 1163 ntTSL 28.97□□□□□ -0.979e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.099e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 FADS2-206ENST00000518606 510 ntTSL 47.91□□□□□ -1.143e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.261e-14■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PPT1-214ENST00000641381 618 nt6.28□□□□□ -1.49e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 AL049779.1-203ENST00000554493 364 ntTSL 25.56□□□□□ -1.529e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 AL049779.1-202ENST00000553582 498 ntTSL 25.01□□□□□ -1.619e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.659e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RDH11-204ENST00000553578 4035 ntTSL 1 (best)4.65□□□□□ -1.679e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.991e-323■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 AL049779.1-204ENST00000557564 274 ntAPPRIS P1 TSL 2-0.96□□□□□ -2.569e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.257e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 321.65■■□□□ 1.067e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.587e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SMARCA4-212ENST00000586985 534 ntTSL 515.87■□□□□ 0.137e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.117e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.017e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SMARCA4-217ENST00000591595 3377 ntTSL 214.79□□□□□ -0.047e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SMARCA4-208ENST00000585799 3842 ntTSL 214.26□□□□□ -0.137e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SMARCA4-211ENST00000586921 569 ntTSL 513.62□□□□□ -0.237e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.121e-323■□□□□ 9
NOLC1Q14978 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.412e-7■□□□□ 9
NOLC1Q14978 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-7■□□□□ 9
NOLC1Q14978 HNRNPH3-211ENST00000491200 2308 ntTSL 1 (best)16.88■□□□□ 0.292e-7■□□□□ 9
NOLC1Q14978 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.212e-7■□□□□ 9
NOLC1Q14978 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 216.14■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 9
NOLC1Q14978 HNRNPH3-210ENST00000490442 1521 ntTSL 216.14■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 9
NOLC1Q14978 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 211.81□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 525.92■■□□□ 1.743e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)25.23■■□□□ 1.633e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 521.14■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.673e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.513e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.483e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 216.8■□□□□ 0.283e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 516.35■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 216.1■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.341e-6■□□□□ 9
NOLC1Q14978 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.463e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.153e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.143e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.113e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.113e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.073e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.053e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.133e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.743e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 218.25■□□□□ 0.513e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 316.59■□□□□ 0.253e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 215.12■□□□□ 0.011e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 23.14□□□□□ -1.911e-8■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.147e-31■□□□□ 9
NOLC1Q14978 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-9■□□□□ 9
NOLC1Q14978 EIF2AK1-202ENST00000422786 782 ntTSL 312.18□□□□□ -0.462e-9■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SERPINA3-206ENST00000555820 981 ntTSL 511.34□□□□□ -0.591e-323■□□□□ 9
NOLC1Q14978 SERPINA3-207ENST00000556388 480 ntTSL 49.46□□□□□ -0.91e-323■□□□□ 9
NOLC1Q14978 ARID1A-207ENST00000524572 546 ntTSL 411.74□□□□□ -0.538e-14■□□□□ 9
NOLC1Q14978 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 55.23□□□□□ -1.578e-14■□□□□ 9
NOLC1Q14978 COX4I1-204ENST00000562929 452 ntTSL 514.01□□□□□ -0.171e-30■□□□□ 9
NOLC1Q14978 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.53□□□□□ -1.361e-8■□□□□ 8.9
NOLC1Q14978 C3-214ENST00000600763 406 ntTSL 317■□□□□ 0.312e-82■□□□□ 8.9
NOLC1Q14978 SERPINF1-206ENST00000571870 739 ntTSL 216.62■□□□□ 0.254e-40■□□□□ 8.9
NOLC1Q14978 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.533e-21■□□□□ 8.9
NOLC1Q14978 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-21■□□□□ 8.9
NOLC1Q14978 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-21■□□□□ 8.9
NOLC1Q14978 SERPINA3-208ENST00000556968 1289 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.473e-21■□□□□ 8.9
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