RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555699.5

LGMN-211, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-211ENST00000555699 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.12■■■■■ 4.01
LGMN-211ENST00000555699 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.52■■■■□ 3.28
LGMN-211ENST00000555699 ABCC9O60706 1549 aa34.71■■■■□ 3.15
LGMN-211ENST00000555699 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.49■■■□□ 2.95
LGMN-211ENST00000555699 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
LGMN-211ENST00000555699 NACADO15069 1562 aa33.34■■■□□ 2.93
LGMN-211ENST00000555699 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.34■■■□□ 2.93
LGMN-211ENST00000555699 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.15■■■□□ 2.9
LGMN-211ENST00000555699 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.12■■■□□ 2.89
LGMN-211ENST00000555699 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.71■■■□□ 2.83
LGMN-211ENST00000555699 SCRIBQ14160 1630 aa32.55■■■□□ 2.8
LGMN-211ENST00000555699 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.5■■■□□ 2.79
LGMN-211ENST00000555699 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.45■■■□□ 2.78
LGMN-211ENST00000555699 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.93■■■□□ 2.7
LGMN-211ENST00000555699 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.77■■■□□ 2.68
LGMN-211ENST00000555699 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
LGMN-211ENST00000555699 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.37■■■□□ 2.61
LGMN-211ENST00000555699 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.33■■■□□ 2.61
LGMN-211ENST00000555699 SMARCA4P51532 1647 aa31.1■■■□□ 2.57
LGMN-211ENST00000555699 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
LGMN-211ENST00000555699 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.99■■■□□ 2.55
LGMN-211ENST00000555699 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.88■■■□□ 2.53
LGMN-211ENST00000555699 NCAPD3P42695 1498 aa30.8■■■□□ 2.52
LGMN-211ENST00000555699 SMARCA2P51531 1590 aa30.78■■■□□ 2.52
LGMN-211ENST00000555699 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.74■■■□□ 2.51
LGMN-211ENST00000555699 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
LGMN-211ENST00000555699 WIZO95785 1651 aa30.67■■■□□ 2.5
LGMN-211ENST00000555699 HMGXB3Q12766 1538 aa30.64■■■□□ 2.5
LGMN-211ENST00000555699 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
LGMN-211ENST00000555699 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
LGMN-211ENST00000555699 NESP48681 1621 aa30.13■■■□□ 2.41
LGMN-211ENST00000555699 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
LGMN-211ENST00000555699 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.96■■■□□ 2.39
LGMN-211ENST00000555699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.93■■■□□ 2.38
LGMN-211ENST00000555699 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.92■■■□□ 2.38
LGMN-211ENST00000555699 ERCC6Q03468 1493 aa29.82■■■□□ 2.36
LGMN-211ENST00000555699 CFTRP13569 1480 aa29.79■■■□□ 2.36
LGMN-211ENST00000555699 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.73■■■□□ 2.35
LGMN-211ENST00000555699 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.71■■■□□ 2.35
LGMN-211ENST00000555699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.6■■■□□ 2.33
LGMN-211ENST00000555699 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
LGMN-211ENST00000555699 PRDM2Q13029 1718 aa29.56■■■□□ 2.32
LGMN-211ENST00000555699 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.52■■■□□ 2.32
LGMN-211ENST00000555699 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.45■■■□□ 2.3
LGMN-211ENST00000555699 CUX2O14529 1486 aa29.39■■■□□ 2.3
LGMN-211ENST00000555699 WDR62O43379 1518 aa29.35■■■□□ 2.29
LGMN-211ENST00000555699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
LGMN-211ENST00000555699 TOPBP1Q92547 1522 aa29.16■■■□□ 2.26
LGMN-211ENST00000555699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.11■■■□□ 2.25
LGMN-211ENST00000555699 CUX1P39880 1505 aa29.05■■■□□ 2.24
LGMN-211ENST00000555699 ABCC8Q09428 1581 aa29.03■■■□□ 2.24
LGMN-211ENST00000555699 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
LGMN-211ENST00000555699 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.9■■■□□ 2.22
LGMN-211ENST00000555699 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
LGMN-211ENST00000555699 IFT140Q96RY7 1462 aa28.87■■■□□ 2.21
LGMN-211ENST00000555699 SYNJ1O43426 1573 aa28.86■■■□□ 2.21
LGMN-211ENST00000555699 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.86■■■□□ 2.21
LGMN-211ENST00000555699 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
LGMN-211ENST00000555699 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
LGMN-211ENST00000555699 TOP2BQ02880 1626 aa28.79■■■□□ 2.2
LGMN-211ENST00000555699 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.79■■■□□ 2.2
LGMN-211ENST00000555699 SOGA1O94964 1423 aa28.79■■■□□ 2.2
LGMN-211ENST00000555699 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
LGMN-211ENST00000555699 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
LGMN-211ENST00000555699 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
LGMN-211ENST00000555699 WDR97A6NE52 1622 aa28.65■■■□□ 2.18
LGMN-211ENST00000555699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.58■■■□□ 2.17
LGMN-211ENST00000555699 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.48■■■□□ 2.15
LGMN-211ENST00000555699 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.46■■■□□ 2.15
LGMN-211ENST00000555699 PBRM1Q86U86 1689 aa28.41■■■□□ 2.14
LGMN-211ENST00000555699 GRIN2BQ13224 1484 aa28.41■■■□□ 2.14
LGMN-211ENST00000555699 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.41■■■□□ 2.14
LGMN-211ENST00000555699 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.33■■■□□ 2.13
LGMN-211ENST00000555699 CHD1O14646 1710 aa28.31■■■□□ 2.12
LGMN-211ENST00000555699 TRIM41Q8WV44 630 aa28.31■■■□□ 2.12
LGMN-211ENST00000555699 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
LGMN-211ENST00000555699 FBLN2P98095 1184 aa28.27■■■□□ 2.12
LGMN-211ENST00000555699 OSCARQ8IYS5 282 aa28.23■■■□□ 2.11
LGMN-211ENST00000555699 KIF27Q86VH2 1401 aa28.22■■■□□ 2.11
LGMN-211ENST00000555699 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.22■■■□□ 2.11
LGMN-211ENST00000555699 SYNJ2O15056 1496 aa28.2■■■□□ 2.11
LGMN-211ENST00000555699 ADAMTS12P58397 1594 aa28.19■■■□□ 2.1
LGMN-211ENST00000555699 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.19■■■□□ 2.1
LGMN-211ENST00000555699 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
LGMN-211ENST00000555699 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.16■■■□□ 2.1
LGMN-211ENST00000555699 IGF1RP08069 1367 aa28.14■■■□□ 2.1
LGMN-211ENST00000555699 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.11■■■□□ 2.09
LGMN-211ENST00000555699 GRIN2AQ12879 1464 aa28.07■■■□□ 2.08
LGMN-211ENST00000555699 CUL7Q14999 1698 aa27.98■■■□□ 2.07
LGMN-211ENST00000555699 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.98■■■□□ 2.07
LGMN-211ENST00000555699 CEP170Q5SW79 1584 aa27.97■■■□□ 2.07
LGMN-211ENST00000555699 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.96■■■□□ 2.07
LGMN-211ENST00000555699 NUP160Q12769 1436 aa27.93■■■□□ 2.06
LGMN-211ENST00000555699 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
LGMN-211ENST00000555699 ARHGEF11O15085 1522 aa27.83■■■□□ 2.05
LGMN-211ENST00000555699 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
LGMN-211ENST00000555699 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
LGMN-211ENST00000555699 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
LGMN-211ENST00000555699 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.79■■■□□ 2.04
LGMN-211ENST00000555699 PRXQ9BXM0 1461 aa27.77■■■□□ 2.04
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