Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.913e-8■■■■■ 219.9
UTP3Q9NQZ2 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.087e-18■■■■■ 219.8
UTP3Q9NQZ2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-9■■■■■ 219.6
UTP3Q9NQZ2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 219.4
UTP3Q9NQZ2 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 217.78■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 219.4
UTP3Q9NQZ2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 219.4
UTP3Q9NQZ2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 219.4
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-203ENST00000418940 582 ntTSL 420.3■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 219.2
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 219.2
UTP3Q9NQZ2 SMARCA4-206ENST00000538456 738 ntTSL 314.78□□□□□ -0.045e-9■■■■■ 219
UTP3Q9NQZ2 BTNL9-208ENST00000512570 885 ntTSL 516.57■□□□□ 0.243e-15■■■■■ 218.9
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-205ENST00000420665 570 ntTSL 325.72■■□□□ 1.712e-9■■■■■ 218.8
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-215ENST00000498053 593 ntTSL 319.06■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 218.8
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-9■■■■■ 218.8
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 218.8
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 218.8
UTP3Q9NQZ2 AC079062.1-205ENST00000582571 744 ntTSL 312.97□□□□□ -0.333e-45■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 323.85■■□□□ 1.416e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 322.33■■□□□ 1.176e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 221.93■■□□□ 1.16e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 218.59■□□□□ 0.576e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.516e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-217ENST00000566893 715 ntTSL 213.3□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)10.86□□□□□ -0.676e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 210.7□□□□□ -0.76e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.036e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.166e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 27.69□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.36e-8■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 PTPA-208ENST00000411917 738 ntTSL 321.57■■□□□ 1.048e-11■■■■■ 218.6
UTP3Q9NQZ2 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 218.5
UTP3Q9NQZ2 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)6.58□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 218.5
UTP3Q9NQZ2 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 218.5
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 414.62□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 218.4
UTP3Q9NQZ2 GNA12-208ENST00000496740 2450 ntTSL 215.24■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 218.3
UTP3Q9NQZ2 GNA12-202ENST00000407653 3785 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 218.3
UTP3Q9NQZ2 GNA12-207ENST00000491117 3375 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 218.3
UTP3Q9NQZ2 GNA12-206ENST00000485329 562 ntTSL 412.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 218.3
UTP3Q9NQZ2 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 218.3
UTP3Q9NQZ2 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 526.79■■□□□ 1.883e-7■■■■■ 218.3
UTP3Q9NQZ2 UNC45A-207ENST00000487875 2641 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 PAXBP1-208ENST00000472588 1410 ntTSL 1 (best)23.94■■□□□ 1.421e-12■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-210ENST00000447414 575 ntTSL 420.37■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-204ENST00000413780 896 ntTSL 319.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-212ENST00000453729 703 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-207ENST00000418247 592 ntTSL 214.79□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-206ENST00000416420 2571 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-208ENST00000428492 539 ntTSL 411.63□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-211ENST00000447875 754 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-209ENST00000431815 568 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-205ENST00000415021 671 ntTSL 1 (best)7.22□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 218
UTP3Q9NQZ2 MAP4-212ENST00000468075 487 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 217.9
UTP3Q9NQZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.085e-7■■■■■ 217.7
UTP3Q9NQZ2 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 217.6
UTP3Q9NQZ2 PTPRJ-206ENST00000534219 546 ntTSL 326.53■■□□□ 1.841e-7■■■■■ 217.6
UTP3Q9NQZ2 PTPRJ-205ENST00000527952 626 ntTSL 525.5■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 217.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.821e-9■■■■■ 217.5
UTP3Q9NQZ2 LAMA5-209ENST00000481120 386 ntTSL 224.12■■□□□ 1.453e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 EML3-215ENST00000526116 581 ntTSL 322.61■■□□□ 1.213e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 EML3-208ENST00000462626 463 ntTSL 222.25■■□□□ 1.153e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 EML3-205ENST00000438258 493 ntTSL 421.78■■□□□ 1.083e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.583e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 CXorf40B-206ENST00000483447 808 ntTSL 516.54■□□□□ 0.243e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 CXorf40B-204ENST00000370409 1129 ntTSL 515.49■□□□□ 0.073e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF783-205ENST00000489518 763 ntTSL 314.26□□□□□ -0.131e-12■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.443e-20■■■■■ 217.4
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-203ENST00000381117 798 ntTSL 1 (best)20.18■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 217.3
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-212ENST00000484523 582 ntTSL 515.25■□□□□ 0.033e-8■■■■■ 217.3
UTP3Q9NQZ2 SF1-216ENST00000486867 875 ntTSL 313.99□□□□□ -0.171e-47■■■■■ 217.2
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-204ENST00000451422 2485 ntTSL 28.23□□□□□ -1.093e-11■■■■■ 217.2
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-212ENST00000497037 3509 ntTSL 25.3□□□□□ -1.563e-11■■■■■ 217.2
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.63e-11■■■■■ 217.2
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-213ENST00000498524 4289 ntTSL 24.61□□□□□ -1.673e-11■■■■■ 217.2
UTP3Q9NQZ2 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 217
UTP3Q9NQZ2 ECD-201ENST00000372979 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 217
UTP3Q9NQZ2 ECD-203ENST00000430082 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 217
UTP3Q9NQZ2 ECD-206ENST00000484976 1679 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 217
UTP3Q9NQZ2 TNPO1-211ENST00000518279 563 ntTSL 417.75■□□□□ 0.438e-12■■■■■ 217
UTP3Q9NQZ2 TNPO1-210ENST00000515483 549 ntTSL 415.74■□□□□ 0.118e-12■■■■■ 217
UTP3Q9NQZ2 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 216.9
UTP3Q9NQZ2 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 213.52□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 216.6
UTP3Q9NQZ2 TSPAN9-208ENST00000640568 1465 ntTSL 523.19■■□□□ 1.32e-18■■■■■ 216.3
UTP3Q9NQZ2 TSPAN9-204ENST00000444315 570 ntTSL 417.92■□□□□ 0.462e-18■■■■■ 216.3
UTP3Q9NQZ2 TSPAN9-203ENST00000431374 558 ntTSL 416.32■□□□□ 0.22e-18■■■■■ 216.3
UTP3Q9NQZ2 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.252e-18■■■■■ 216.3
UTP3Q9NQZ2 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-18■■■■■ 216.3
UTP3Q9NQZ2 TSPAN9-202ENST00000407263 956 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.642e-18■■■■■ 216.3
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-212ENST00000494929 550 ntTSL 416.03■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 216.1
UTP3Q9NQZ2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 216.1
UTP3Q9NQZ2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 216.1
UTP3Q9NQZ2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 216
UTP3Q9NQZ2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 216
UTP3Q9NQZ2 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 216
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