Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZDHHC9Q9Y397 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZDHHC9Q9Y397 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZDHHC9Q9Y397 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZDHHC9Q9Y397 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZDHHC9Q9Y397 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms