Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP22Q9UPT9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP22Q9UPT9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP22Q9UPT9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms