Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX12Q9UMY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX12Q9UMY4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX12Q9UMY4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX12Q9UMY4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX12Q9UMY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms