Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SNX12Q9UMY4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SNX12Q9UMY4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SNX12Q9UMY4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SNX12Q9UMY4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNX12Q9UMY4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SNX12Q9UMY4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SNX12Q9UMY4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SNX12Q9UMY4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SNX12Q9UMY4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SNX12Q9UMY4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNX12Q9UMY4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNX12Q9UMY4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNX12Q9UMY4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SNX12Q9UMY4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SNX12Q9UMY4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SNX12Q9UMY4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNX12Q9UMY4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNX12Q9UMY4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNX12Q9UMY4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SNX12Q9UMY4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNX12Q9UMY4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SNX12Q9UMY4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SNX12Q9UMY4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SNX12Q9UMY4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SNX12Q9UMY4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SNX12Q9UMY4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SNX12Q9UMY4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNX12Q9UMY4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SNX12Q9UMY4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SNX12Q9UMY4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SNX12Q9UMY4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SNX12Q9UMY4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNX12Q9UMY4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SNX12Q9UMY4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SNX12Q9UMY4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SNX12Q9UMY4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SNX12Q9UMY4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SNX12Q9UMY4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SNX12Q9UMY4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SNX12Q9UMY4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNX12Q9UMY4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SNX12Q9UMY4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNX12Q9UMY4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNX12Q9UMY4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SNX12Q9UMY4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SNX12Q9UMY4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SNX12Q9UMY4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX12Q9UMY4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX12Q9UMY4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SNX12Q9UMY4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SNX12Q9UMY4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SNX12Q9UMY4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SNX12Q9UMY4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SNX12Q9UMY4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNX12Q9UMY4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SNX12Q9UMY4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SNX12Q9UMY4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNX12Q9UMY4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SNX12Q9UMY4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SNX12Q9UMY4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SNX12Q9UMY4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNX12Q9UMY4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNX12Q9UMY4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNX12Q9UMY4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SNX12Q9UMY4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SNX12Q9UMY4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNX12Q9UMY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNX12Q9UMY4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNX12Q9UMY4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX12Q9UMY4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX12Q9UMY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX12Q9UMY4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX12Q9UMY4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNX12Q9UMY4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNX12Q9UMY4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNX12Q9UMY4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SNX12Q9UMY4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SNX12Q9UMY4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SNX12Q9UMY4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SNX12Q9UMY4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNX12Q9UMY4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNX12Q9UMY4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX12Q9UMY4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNX12Q9UMY4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX12Q9UMY4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX12Q9UMY4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX12Q9UMY4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX12Q9UMY4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNX12Q9UMY4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX12Q9UMY4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX12Q9UMY4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX12Q9UMY4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SNX12Q9UMY4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SNX12Q9UMY4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX12Q9UMY4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX12Q9UMY4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SNX12Q9UMY4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SNX12Q9UMY4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNX12Q9UMY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms