Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRID1Q9ULK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GRID1Q9ULK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRID1Q9ULK0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRID1Q9ULK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms