Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRID1Q9ULK0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRID1Q9ULK0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRID1Q9ULK0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRID1Q9ULK0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRID1Q9ULK0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRID1Q9ULK0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
GRID1Q9ULK0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRID1Q9ULK0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRID1Q9ULK0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRID1Q9ULK0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRID1Q9ULK0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRID1Q9ULK0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GRID1Q9ULK0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRID1Q9ULK0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRID1Q9ULK0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRID1Q9ULK0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRID1Q9ULK0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRID1Q9ULK0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRID1Q9ULK0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRID1Q9ULK0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRID1Q9ULK0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GRID1Q9ULK0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRID1Q9ULK0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRID1Q9ULK0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRID1Q9ULK0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRID1Q9ULK0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRID1Q9ULK0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRID1Q9ULK0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRID1Q9ULK0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRID1Q9ULK0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRID1Q9ULK0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRID1Q9ULK0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRID1Q9ULK0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRID1Q9ULK0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRID1Q9ULK0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRID1Q9ULK0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRID1Q9ULK0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRID1Q9ULK0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRID1Q9ULK0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRID1Q9ULK0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRID1Q9ULK0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRID1Q9ULK0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRID1Q9ULK0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRID1Q9ULK0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRID1Q9ULK0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRID1Q9ULK0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRID1Q9ULK0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRID1Q9ULK0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRID1Q9ULK0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRID1Q9ULK0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRID1Q9ULK0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRID1Q9ULK0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRID1Q9ULK0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRID1Q9ULK0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRID1Q9ULK0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRID1Q9ULK0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRID1Q9ULK0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRID1Q9ULK0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRID1Q9ULK0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRID1Q9ULK0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRID1Q9ULK0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRID1Q9ULK0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRID1Q9ULK0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRID1Q9ULK0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRID1Q9ULK0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRID1Q9ULK0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRID1Q9ULK0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRID1Q9ULK0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRID1Q9ULK0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRID1Q9ULK0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRID1Q9ULK0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRID1Q9ULK0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRID1Q9ULK0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRID1Q9ULK0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRID1Q9ULK0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRID1Q9ULK0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRID1Q9ULK0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRID1Q9ULK0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRID1Q9ULK0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRID1Q9ULK0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRID1Q9ULK0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRID1Q9ULK0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRID1Q9ULK0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRID1Q9ULK0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRID1Q9ULK0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRID1Q9ULK0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRID1Q9ULK0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRID1Q9ULK0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRID1Q9ULK0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRID1Q9ULK0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRID1Q9ULK0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRID1Q9ULK0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRID1Q9ULK0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRID1Q9ULK0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRID1Q9ULK0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRID1Q9ULK0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRID1Q9ULK0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRID1Q9ULK0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRID1Q9ULK0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms