Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM10Q9UDY6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM10Q9UDY6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM10Q9UDY6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM10Q9UDY6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 326.5 ms