Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDP1Q9P0J1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDP1Q9P0J1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDP1Q9P0J1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDP1Q9P0J1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms