Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP5Q9NZZ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP5Q9NZZ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP5Q9NZZ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP5Q9NZZ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP5Q9NZZ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMP5Q9NZZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP5Q9NZZ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHMP5Q9NZZ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHMP5Q9NZZ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms