Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAM3Q9BX67 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JAM3Q9BX67 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
JAM3Q9BX67 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms