Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHID1Q9BWS9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHID1Q9BWS9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHID1Q9BWS9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHID1Q9BWS9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHID1Q9BWS9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHID1Q9BWS9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHID1Q9BWS9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHID1Q9BWS9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHID1Q9BWS9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHID1Q9BWS9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHID1Q9BWS9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms