Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHFPL3Q86UP9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHFPL3Q86UP9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHFPL3Q86UP9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHFPL3Q86UP9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms