Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD2Q6Y1H2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD2Q6Y1H2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD2Q6Y1H2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HACD2Q6Y1H2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACD2Q6Y1H2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms