Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HACD2Q6Y1H2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HACD2Q6Y1H2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HACD2Q6Y1H2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
HACD2Q6Y1H2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HACD2Q6Y1H2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
HACD2Q6Y1H2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACD2Q6Y1H2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HACD2Q6Y1H2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HACD2Q6Y1H2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HACD2Q6Y1H2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HACD2Q6Y1H2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HACD2Q6Y1H2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HACD2Q6Y1H2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HACD2Q6Y1H2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HACD2Q6Y1H2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
HACD2Q6Y1H2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HACD2Q6Y1H2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HACD2Q6Y1H2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HACD2Q6Y1H2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HACD2Q6Y1H2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HACD2Q6Y1H2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HACD2Q6Y1H2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HACD2Q6Y1H2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HACD2Q6Y1H2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HACD2Q6Y1H2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HACD2Q6Y1H2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACD2Q6Y1H2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HACD2Q6Y1H2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACD2Q6Y1H2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HACD2Q6Y1H2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HACD2Q6Y1H2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HACD2Q6Y1H2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HACD2Q6Y1H2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HACD2Q6Y1H2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HACD2Q6Y1H2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HACD2Q6Y1H2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HACD2Q6Y1H2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HACD2Q6Y1H2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HACD2Q6Y1H2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HACD2Q6Y1H2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACD2Q6Y1H2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HACD2Q6Y1H2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HACD2Q6Y1H2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HACD2Q6Y1H2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HACD2Q6Y1H2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HACD2Q6Y1H2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HACD2Q6Y1H2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HACD2Q6Y1H2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HACD2Q6Y1H2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HACD2Q6Y1H2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HACD2Q6Y1H2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACD2Q6Y1H2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HACD2Q6Y1H2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HACD2Q6Y1H2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACD2Q6Y1H2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACD2Q6Y1H2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACD2Q6Y1H2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACD2Q6Y1H2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACD2Q6Y1H2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACD2Q6Y1H2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HACD2Q6Y1H2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACD2Q6Y1H2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HACD2Q6Y1H2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACD2Q6Y1H2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACD2Q6Y1H2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACD2Q6Y1H2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HACD2Q6Y1H2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HACD2Q6Y1H2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HACD2Q6Y1H2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HACD2Q6Y1H2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACD2Q6Y1H2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACD2Q6Y1H2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HACD2Q6Y1H2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HACD2Q6Y1H2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HACD2Q6Y1H2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HACD2Q6Y1H2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HACD2Q6Y1H2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HACD2Q6Y1H2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HACD2Q6Y1H2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HACD2Q6Y1H2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HACD2Q6Y1H2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HACD2Q6Y1H2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HACD2Q6Y1H2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACD2Q6Y1H2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACD2Q6Y1H2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACD2Q6Y1H2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACD2Q6Y1H2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HACD2Q6Y1H2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HACD2Q6Y1H2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACD2Q6Y1H2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACD2Q6Y1H2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACD2Q6Y1H2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HACD2Q6Y1H2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACD2Q6Y1H2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACD2Q6Y1H2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACD2Q6Y1H2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACD2Q6Y1H2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACD2Q6Y1H2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HACD2Q6Y1H2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms